More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1282 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 296 aa  597  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  83.78 
 
 		 295 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  62.45 
 
 		 274 aa  330  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  61.29 
 
 		 280 aa  329  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.19 
 
 		 279 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.15 
 
 		 272 aa  302  5.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  53.07 
 
 		 291 aa  298  8e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.2 
 
 		 284 aa  296  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.04 
 
 		 284 aa  296  3e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  53.07 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.15 
 
 		 284 aa  294  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.76 
 
 		 289 aa  293  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.48 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.76 
 
 		 275 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  51.62 
 
 		 293 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.07 
 
 		 284 aa  289  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  52.35 
 
 		 293 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  52.17 
 
 		 269 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  50.54 
 
 		 298 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  51.81 
 
 		 269 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  54.15 
 
 		 285 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  51.99 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  52.35 
 
 		 289 aa  277  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  53.07 
 
 		 285 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  53.07 
 
 		 285 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  53.07 
 
 		 285 aa  275  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  54.15 
 
 		 277 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  52.49 
 
 		 284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  52.49 
 
 		 284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  52.49 
 
 		 284 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  52.71 
 
 		 273 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  51.99 
 
 		 274 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  51.62 
 
 		 274 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 		 275 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  52.67 
 
 		 282 aa  265  8e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  51.26 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  52.16 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  48.92 
 
 		 274 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  50.18 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  51.53 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 		 273 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  53.44 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  54.2 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  49.47 
 
 		 278 aa  249  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  47.46 
 
 		 274 aa  248  9e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.46 
 
 		 290 aa  233  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.13 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.34 
 
 		 292 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 		 283 aa  159  7e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  32.59 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.28 
 
 		 246 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  33.01 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 240 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 		 246 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.4 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 235 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 287 aa  99  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 		 268 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 		 260 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 253 aa  94  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.14 
 
 		 262 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.534648  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.93 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 		 268 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 		 238 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  30.93 
 
 		 269 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1678  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.91 
 
 		 255 aa  89.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 		 268 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 		 245 aa  89  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 255 aa  89  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 292 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.12 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 		 254 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38394  predicted protein  31.65 
 
 		 276 aa  89  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00142595  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.41 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.41 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  30 
 
 		 265 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.41 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.61 
 
 		 270 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 299 aa  87.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.41 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 242 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.162466 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>