More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4153 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  47.99 
 
 
280 aa  262  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  47.79 
 
 
274 aa  245  4.9999999999999997e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  47.31 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  47.65 
 
 
295 aa  240  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.64 
 
 
284 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
289 aa  239  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  45.96 
 
 
273 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.17 
 
 
289 aa  236  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
279 aa  234  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  46.74 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  45.22 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  45.59 
 
 
274 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  44.85 
 
 
273 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  44.85 
 
 
274 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  44.85 
 
 
274 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  42.14 
 
 
293 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  40.71 
 
 
293 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  45.13 
 
 
296 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  44.49 
 
 
273 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 
275 aa  228  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 
284 aa  228  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  46.9 
 
 
286 aa  227  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  41.07 
 
 
291 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
284 aa  225  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  41.48 
 
 
269 aa  225  7e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  44.57 
 
 
278 aa  225  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  41.85 
 
 
269 aa  224  9e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  40.36 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  44.69 
 
 
272 aa  222  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
272 aa  222  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  44.88 
 
 
289 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  41.39 
 
 
274 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  41.86 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.58 
 
 
290 aa  213  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  40.29 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  41.86 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  42.07 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  41.86 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  41.09 
 
 
275 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 
282 aa  209  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
284 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
271 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  40.07 
 
 
281 aa  205  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 
284 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  39.43 
 
 
281 aa  195  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
287 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 
283 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 
287 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 
292 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
246 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
246 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.67 
 
 
295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
244 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
309 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
295 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
295 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
295 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
262 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  30.19 
 
 
263 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  34.72 
 
 
255 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
262 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.526951  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
262 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
262 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
262 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
261 aa  99.8  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.1 
 
 
262 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
270 aa  99  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
246 aa  99  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
269 aa  98.6  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
243 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
239 aa  96.7  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
255 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.53 
 
 
299 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.02 
 
 
266 aa  95.5  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 
254 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0936  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  34.78 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.664798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
251 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.71 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2242  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218659  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.81 
 
 
247 aa  92.8  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.38 
 
 
235 aa  92.8  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
246 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
261 aa  92.8  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
260 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
254 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.98 
 
 
266 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.54 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5189  gluconate 5-dehydrogenase (5-keto-D-gluconate 5- reductase)  36.13 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>