More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3813 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  83.15 
 
 		 289 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  82.59 
 
 		 286 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.76 
 
 		 284 aa  316  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  59.41 
 
 		 274 aa  310  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  56 
 
 		 280 aa  309  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  55.64 
 
 		 298 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.7 
 
 		 279 aa  288  8e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  53.31 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  53.7 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  55.8 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.09 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  51.66 
 
 		 271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  51.36 
 
 		 293 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  54.69 
 
 		 273 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.55 
 
 		 272 aa  278  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  53.91 
 
 		 273 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  53.52 
 
 		 273 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  54.61 
 
 		 285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  50.91 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  50.91 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  50.91 
 
 		 284 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  52 
 
 		 282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.53 
 
 		 284 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  50.74 
 
 		 274 aa  271  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  53.09 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.75 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.94 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 		 277 aa  266  4e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  53.28 
 
 		 284 aa  265  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.33 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  53.07 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 281 aa  262  4e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.75 
 
 		 284 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 		 272 aa  261  6.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  49.82 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  51.29 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  46.64 
 
 		 269 aa  258  9e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  45.93 
 
 		 269 aa  256  3e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  48.91 
 
 		 275 aa  255  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  50.36 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  46.35 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  46.55 
 
 		 274 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  45.82 
 
 		 274 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.74 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  37.16 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 287 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.36 
 
 		 236 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 		 240 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 246 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 		 246 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.84 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  32.14 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.43 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 		 251 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.61 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.761218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 		 251 aa  99  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 293 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  31.98 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 305 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  34.34 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 		 244 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.51 
 
 		 256 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.69 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 		 259 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 		 309 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.08 
 
 		 255 aa  96.3  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 254 aa  95.9  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.749829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 		 249 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 		 354 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  32.2 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 		 295 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.81 
 
 		 249 aa  95.5  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 285 aa  95.5  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.65 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.24 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2694  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier- protein) reductase  34.9 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 264 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.8 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  29.49 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>