More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2838 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 284 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.61 
 
 		 284 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.1 
 
 		 289 aa  488  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.1 
 
 		 284 aa  484  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.04 
 
 		 289 aa  481  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  73.12 
 
 		 298 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  73.48 
 
 		 293 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  72.76 
 
 		 291 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  72.04 
 
 		 293 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.65 
 
 		 272 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  66.43 
 
 		 285 aa  371  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  64.21 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.71 
 
 		 279 aa  359  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.73 
 
 		 275 aa  344  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  62.73 
 
 		 273 aa  338  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  62.64 
 
 		 280 aa  337  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  63.84 
 
 		 273 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  62.36 
 
 		 273 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.35 
 
 		 284 aa  334  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  61.99 
 
 		 273 aa  333  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  58.99 
 
 		 282 aa  331  7.000000000000001e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.93 
 
 		 290 aa  324  1e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  56.88 
 
 		 269 aa  320  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  59.04 
 
 		 274 aa  318  3.9999999999999996e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  61.25 
 
 		 277 aa  318  7e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  56.51 
 
 		 269 aa  317  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  57.55 
 
 		 281 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  59.04 
 
 		 272 aa  315  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  57.3 
 
 		 284 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  56.27 
 
 		 284 aa  310  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  58.01 
 
 		 281 aa  310  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  55.91 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  55.91 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  57.04 
 
 		 275 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  55.11 
 
 		 274 aa  301  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  57.97 
 
 		 278 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  56.04 
 
 		 274 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  56.04 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  56.04 
 
 		 274 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  53.14 
 
 		 274 aa  285  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  52.9 
 
 		 295 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  53.07 
 
 		 296 aa  281  9e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  51.75 
 
 		 285 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  51.75 
 
 		 285 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  52.53 
 
 		 286 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  51.75 
 
 		 285 aa  266  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  50.98 
 
 		 289 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.81 
 
 		 287 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.65 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 		 292 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  36.69 
 
 		 283 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  34.83 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 		 246 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 246 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 		 246 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.58 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 		 246 aa  109  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  29.05 
 
 		 236 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.76 
 
 		 259 aa  99  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5382  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.712878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.2 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  33.17 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.41 
 
 		 246 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 		 309 aa  92.8  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 		 240 aa  92.8  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.2 
 
 		 249 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 		 249 aa  92.4  8e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 245 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  31.45 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2097  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  32.99 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 		 251 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.46 
 
 		 268 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.99 
 
 		 249 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 270 aa  89.4  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 		 249 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 		 249 aa  89  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 		 260 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.05 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3486  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.67 
 
 		 248 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.64 
 
 		 246 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>