More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2352 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 283 aa  570  1e-161  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.59 
 
 		 292 aa  422  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  71.23 
 
 		 287 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.77 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  43.36 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  42.48 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  42.58 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  42.19 
 
 		 273 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  40.98 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.3 
 
 		 275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 		 273 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.31 
 
 		 272 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  37.59 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  38.78 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 269 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  39.76 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  37.6 
 
 		 281 aa  175  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  37.26 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  40.7 
 
 		 281 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  37.96 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  36.05 
 
 		 282 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 		 284 aa  169  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  40.15 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 		 274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 		 284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  37.68 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  39 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40.38 
 
 		 274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  37.77 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  37.68 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  39.1 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 		 293 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  36.26 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 		 278 aa  152  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  38.26 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 		 285 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  33.59 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 		 287 aa  135  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.102966  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3854  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0942862  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 		 273 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.55 
 
 		 247 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.14 
 
 		 272 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0565496  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 246 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 246 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 248 aa  95.5  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.15 
 
 		 246 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.46 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0640347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3674  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.41 
 
 		 246 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.25 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.04 
 
 		 258 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.68 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  32.12 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  32.12 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  32.12 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  32.12 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  32.12 
 
 		 263 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.91 
 
 		 266 aa  92.8  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3899  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.9 
 
 		 246 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000498723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 		 266 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3893  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.9 
 
 		 246 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1293  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.9 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.252649  hitchhiker  0.0000000000000846656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  30.96 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.97 
 
 		 287 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3950  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.9 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 		 257 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.96 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.708737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3702  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.9 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.852261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.9 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.9 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3989  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.9 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0408742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.89 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3865  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.9 
 
 		 246 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78131e-47 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1286  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.58 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0358069  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 		 245 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.69 
 
 		 246 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3672  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 		 299 aa  89.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.46 
 
 		 240 aa  89  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.47 
 
 		 248 aa  89  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3335  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.38 
 
 		 260 aa  89  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>