More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3612 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 289 aa  587  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.59 
 
 		 284 aa  568  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  92.39 
 
 		 289 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.1 
 
 		 284 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.04 
 
 		 284 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  72.5 
 
 		 293 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  71.43 
 
 		 298 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  70.36 
 
 		 293 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  71.43 
 
 		 291 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.79 
 
 		 272 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  65.6 
 
 		 285 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  62.5 
 
 		 271 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.02 
 
 		 275 aa  358  6e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.68 
 
 		 279 aa  358  7e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  63 
 
 		 280 aa  341  8e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  61.99 
 
 		 273 aa  334  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  61.99 
 
 		 273 aa  332  3e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  61.62 
 
 		 273 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  58.51 
 
 		 282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.01 
 
 		 284 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  60.89 
 
 		 273 aa  326  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  59.78 
 
 		 272 aa  323  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  59.93 
 
 		 277 aa  318  9e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  58.21 
 
 		 284 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  59.34 
 
 		 274 aa  316  3e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.79 
 
 		 290 aa  315  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  57.86 
 
 		 281 aa  315  4e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  56.94 
 
 		 284 aa  314  9e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  55.39 
 
 		 269 aa  314  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  56.94 
 
 		 284 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  56.94 
 
 		 284 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  55.02 
 
 		 269 aa  311  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  57.5 
 
 		 281 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  56.88 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  56.25 
 
 		 274 aa  298  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  57.61 
 
 		 278 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  55.88 
 
 		 274 aa  295  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  53.48 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  55.51 
 
 		 274 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  53.96 
 
 		 295 aa  289  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  54.48 
 
 		 296 aa  289  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  52.4 
 
 		 274 aa  281  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  52.33 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  52.33 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  52.33 
 
 		 285 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  51.36 
 
 		 286 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  47.71 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.12 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 		 287 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  37.46 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  34.59 
 
 		 263 aa  143  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 246 aa  112  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5382  short chain dehydrogenase  37.11 
 
 		 247 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.712878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 265 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.77 
 
 		 236 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.3 
 
 		 246 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.66 
 
 		 268 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 		 246 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 		 248 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3486  short chain dehydrogenase  35.38 
 
 		 247 aa  95.9  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.98 
 
 		 246 aa  95.9  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 240 aa  95.9  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2097  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.38 
 
 		 249 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0957  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 295 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  35.26 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.2 
 
 		 249 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.56 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.56 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 		 260 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  31.82 
 
 		 269 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 		 265 aa  93.2  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 		 295 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 		 246 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.09 
 
 		 239 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0425  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 		 241 aa  92.4  8e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.116852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.09 
 
 		 239 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.09 
 
 		 239 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.09 
 
 		 239 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.09 
 
 		 242 aa  92  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.09 
 
 		 242 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.09 
 
 		 242 aa  92  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.09 
 
 		 242 aa  92  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>