More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2262 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  98.18 
 
 		 274 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  86.5 
 
 		 274 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  74.55 
 
 		 274 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  63.24 
 
 		 274 aa  349  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.88 
 
 		 272 aa  327  9e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.62 
 
 		 279 aa  321  8e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  55.19 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  55.19 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.51 
 
 		 289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.88 
 
 		 289 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.45 
 
 		 275 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.31 
 
 		 284 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  54.78 
 
 		 293 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.04 
 
 		 284 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  54.04 
 
 		 271 aa  299  4e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  53.31 
 
 		 293 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  57.14 
 
 		 273 aa  296  4e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  52.94 
 
 		 291 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  55.31 
 
 		 285 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.65 
 
 		 284 aa  290  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  52.21 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 		 284 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  54.95 
 
 		 272 aa  285  5.999999999999999e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  54.04 
 
 		 273 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  51.82 
 
 		 280 aa  278  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  54.04 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  52.16 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  54.04 
 
 		 273 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  54.21 
 
 		 277 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  51.65 
 
 		 274 aa  265  5e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  49.64 
 
 		 282 aa  264  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  51.26 
 
 		 296 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  50.36 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  51.09 
 
 		 284 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  50.38 
 
 		 281 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  49.63 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  49.26 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  49.26 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  50.9 
 
 		 278 aa  255  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 281 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.35 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  45.82 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  45.82 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  45.82 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  43.96 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  44.93 
 
 		 286 aa  231  9e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.85 
 
 		 287 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 		 292 aa  199  6e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  39.18 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  39.16 
 
 		 283 aa  172  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.2 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 		 266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  33.68 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.33 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.31 
 
 		 247 aa  109  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.36 
 
 		 253 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  37.31 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  35.57 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.31 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.180623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.68 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2284  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.96 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  31.94 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0124  acetoin reductase  35.71 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.172897  normal  0.526201 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0789  acetoin reductases  37.62 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.867312  normal  0.657499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.42 
 
 		 247 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1787  short chain dehydrogenase  34 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.6 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 295 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.72 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.61 
 
 		 309 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6492  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.110224  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  32.99 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>