More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25480 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 
274 aa  549  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  66.55 
 
 
280 aa  363  2e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.41 
 
 
272 aa  347  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.76 
 
 
284 aa  341  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.35 
 
 
279 aa  340  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.78 
 
 
284 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.04 
 
 
284 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  61.96 
 
 
295 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  62.45 
 
 
296 aa  333  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  58.67 
 
 
291 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.34 
 
 
284 aa  331  7.000000000000001e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.34 
 
 
289 aa  330  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.51 
 
 
289 aa  328  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  56.83 
 
 
298 aa  328  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  57.35 
 
 
293 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  59.41 
 
 
285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  59.41 
 
 
285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  59.41 
 
 
285 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  55.88 
 
 
293 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.3 
 
 
275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  57.93 
 
 
284 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  61.76 
 
 
277 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  59.77 
 
 
284 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  59.77 
 
 
284 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  55.39 
 
 
269 aa  321  7e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  55.88 
 
 
282 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  54.65 
 
 
269 aa  319  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  58.09 
 
 
273 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  56.32 
 
 
281 aa  311  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  56.25 
 
 
284 aa  311  9e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  57.35 
 
 
273 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  56.25 
 
 
272 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  56.99 
 
 
273 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  56.46 
 
 
286 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  53.14 
 
 
271 aa  306  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  54.58 
 
 
289 aa  304  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  55.51 
 
 
281 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  55.51 
 
 
273 aa  301  9e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  56.09 
 
 
285 aa  298  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  57.5 
 
 
278 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  55.43 
 
 
275 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  51.28 
 
 
274 aa  288  8e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  48.18 
 
 
274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  52.01 
 
 
274 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  51.65 
 
 
274 aa  278  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.51 
 
 
290 aa  275  7e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  50 
 
 
274 aa  275  8e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.79 
 
 
287 aa  249  4e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
292 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  40.38 
 
 
283 aa  172  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.35 
 
 
287 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  38.34 
 
 
263 aa  148  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.93 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
246 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
246 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
246 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  36.92 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.58 
 
 
246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
295 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
287 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
260 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.47 
 
 
236 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.83 
 
 
248 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.08 
 
 
268 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
235 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
260 aa  102  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.38 
 
 
249 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
309 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.66 
 
 
239 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
268 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.08 
 
 
249 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
255 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
295 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.56 
 
 
295 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2097  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.55 
 
 
249 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0232  acetoin reductases  33.16 
 
 
259 aa  99.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
249 aa  99  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
254 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.99 
 
 
245 aa  98.2  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
239 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  34.32 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
239 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
239 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
239 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
239 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.73 
 
 
259 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
245 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
265 aa  95.5  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>