More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2109 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
275 aa  552  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.98 
 
 
279 aa  394  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.18 
 
 
272 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.15 
 
 
284 aa  361  6e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.41 
 
 
289 aa  360  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.02 
 
 
289 aa  358  5e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  61.68 
 
 
271 aa  355  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.45 
 
 
284 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.73 
 
 
284 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  59.85 
 
 
293 aa  341  8e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  63.5 
 
 
273 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  63.14 
 
 
273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  63.14 
 
 
273 aa  339  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  58.76 
 
 
298 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  58.76 
 
 
293 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  59.49 
 
 
291 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  62.77 
 
 
272 aa  335  3.9999999999999995e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  61.45 
 
 
285 aa  334  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  61.31 
 
 
273 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  60.77 
 
 
280 aa  323  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 
284 aa  317  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  60.95 
 
 
277 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  57.3 
 
 
274 aa  310  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  52.57 
 
 
269 aa  310  1e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  52.57 
 
 
269 aa  309  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  56.41 
 
 
284 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  58.2 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  58.2 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  55.73 
 
 
282 aa  306  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  56.11 
 
 
281 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  51.64 
 
 
274 aa  300  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  54.21 
 
 
274 aa  299  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  55.4 
 
 
295 aa  296  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  57.25 
 
 
284 aa  294  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  54.18 
 
 
274 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  53.45 
 
 
274 aa  294  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  56.87 
 
 
281 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  53.45 
 
 
274 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  57.55 
 
 
278 aa  290  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  54.48 
 
 
275 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  53.76 
 
 
296 aa  285  4e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.18 
 
 
290 aa  284  9e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  54.09 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  54.09 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  54.09 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  50.19 
 
 
286 aa  258  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  48.82 
 
 
289 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.23 
 
 
287 aa  218  7e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.21 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  41.3 
 
 
283 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
287 aa  178  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  37.69 
 
 
263 aa  159  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
246 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
246 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
246 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
246 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.74 
 
 
246 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
257 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 
268 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.5 
 
 
239 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  32.99 
 
 
269 aa  99.8  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  27.69 
 
 
236 aa  99.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  26.98 
 
 
247 aa  99.4  6e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
266 aa  99  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.416605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.86 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3826  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.136415  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29 
 
 
242 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.96 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
260 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.2 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.84 
 
 
248 aa  96.3  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
268 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.4 
 
 
246 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  34.02 
 
 
250 aa  95.9  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
264 aa  95.9  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 
257 aa  95.9  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
249 aa  95.9  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.207761 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  31.5 
 
 
257 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.6 
 
 
241 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  28.52 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0259011  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
253 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260507  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  28.94 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>