More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4014 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  100 
 
 
284 aa  578  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  87.14 
 
 
284 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  86.79 
 
 
284 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  86.79 
 
 
284 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  85.11 
 
 
281 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  83.51 
 
 
282 aa  491  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  83.69 
 
 
281 aa  482  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.02 
 
 
284 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  56.84 
 
 
291 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  57.8 
 
 
293 aa  328  9e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.57 
 
 
289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  56.74 
 
 
298 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  57.76 
 
 
280 aa  323  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  55.67 
 
 
293 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.65 
 
 
284 aa  322  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.3 
 
 
284 aa  322  5e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.09 
 
 
279 aa  322  5e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.21 
 
 
289 aa  321  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  58.3 
 
 
271 aa  320  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.99 
 
 
272 aa  318  7.999999999999999e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.23 
 
 
284 aa  318  9e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.25 
 
 
275 aa  305  6e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  56.25 
 
 
274 aa  301  7.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  57.35 
 
 
277 aa  295  6e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  56.58 
 
 
285 aa  295  6e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  56.46 
 
 
273 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  56.46 
 
 
273 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  56.09 
 
 
273 aa  292  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  55.51 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  50.56 
 
 
269 aa  283  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  53.6 
 
 
275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  55.96 
 
 
278 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  50.19 
 
 
269 aa  281  9e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  53.28 
 
 
285 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  53.28 
 
 
285 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  53.28 
 
 
285 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  54.79 
 
 
295 aa  272  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  52.55 
 
 
274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  49.45 
 
 
274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  51.82 
 
 
274 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  51.09 
 
 
274 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.6 
 
 
290 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  50.74 
 
 
272 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  54.2 
 
 
296 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  48.16 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  48.72 
 
 
289 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  48.16 
 
 
286 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.02 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.29 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.98 
 
 
287 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 
283 aa  168  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  36.94 
 
 
263 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.44 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
246 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
246 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
246 aa  109  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
249 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
248 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
254 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
255 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
295 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
251 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
251 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
251 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
246 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
295 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
242 aa  99.4  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.162466 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
295 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.34 
 
 
295 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
250 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.805502  normal  0.135775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
309 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3486  short chain dehydrogenase  33.51 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425497  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.68 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02300  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.03 
 
 
250 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257704  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
245 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.16 
 
 
249 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
245 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.29 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.09 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 
253 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.9 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4359  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
249 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.72 
 
 
241 aa  89.4  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
261 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4227  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
249 aa  89.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0991  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.67 
 
 
284 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1019  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.67 
 
 
284 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.945266 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1009  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.67 
 
 
284 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
254 aa  89  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
248 aa  89  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0112  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16629  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>