More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1326 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  100 
 
 
295 aa  593  1e-168  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  83.78 
 
 
296 aa  486  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  60.43 
 
 
280 aa  321  8e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  61.96 
 
 
274 aa  319  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  53.62 
 
 
271 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.31 
 
 
279 aa  300  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.4 
 
 
275 aa  296  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.54 
 
 
272 aa  293  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  52.54 
 
 
291 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  52.9 
 
 
293 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.96 
 
 
289 aa  289  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.6 
 
 
289 aa  290  3e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  54.71 
 
 
286 aa  288  7e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.24 
 
 
284 aa  288  9e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.16 
 
 
284 aa  286  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.99 
 
 
284 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  52.92 
 
 
269 aa  285  8e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  52.54 
 
 
293 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  52.92 
 
 
269 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  55.8 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  55.8 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  55.8 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.9 
 
 
284 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  54.74 
 
 
289 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  50.72 
 
 
298 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  54.35 
 
 
285 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  54.02 
 
 
282 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  53.24 
 
 
277 aa  271  9e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  52.49 
 
 
281 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  50.76 
 
 
284 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  50.76 
 
 
284 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  50.76 
 
 
284 aa  269  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  53.64 
 
 
281 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  52.54 
 
 
273 aa  265  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  48.93 
 
 
275 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  51.99 
 
 
274 aa  261  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  51.45 
 
 
273 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  51.45 
 
 
273 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  50.72 
 
 
273 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  54.79 
 
 
284 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  51.45 
 
 
274 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  48.38 
 
 
274 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  51.26 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  50.36 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  49.64 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  48.36 
 
 
274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.65 
 
 
287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.55 
 
 
290 aa  231  1e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.85 
 
 
292 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
287 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
283 aa  159  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  33.71 
 
 
263 aa  129  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.28 
 
 
246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 
295 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 
295 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
309 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
287 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
246 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
246 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
246 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
246 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  32.35 
 
 
236 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
240 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
295 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
344 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
266 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.106606  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1948  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
295 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
269 aa  96.7  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
262 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  30.73 
 
 
265 aa  96.3  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
262 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.534648  normal  0.433555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.09 
 
 
268 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
238 aa  92.8  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
235 aa  92.8  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
245 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
354 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3319  d-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.63 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0697406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
263 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 
250 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3692  short chain dehydrogenase  34.58 
 
 
256 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31077  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
248 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6224  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
255 aa  89.7  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000552131  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
254 aa  89.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
266 aa  89.7  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
242 aa  89.4  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.162466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  31.64 
 
 
257 aa  89.4  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
249 aa  89  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.41 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>