More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4262 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 289 aa  581  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  87.23 
 
 		 286 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  83.15 
 
 		 285 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  83.15 
 
 		 285 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  83.15 
 
 		 285 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  52.9 
 
 		 280 aa  288  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  54.58 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.35 
 
 		 284 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  54.74 
 
 		 295 aa  282  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  52.16 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  49.09 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.67 
 
 		 279 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  49.81 
 
 		 293 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  50.59 
 
 		 291 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  52.35 
 
 		 296 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.88 
 
 		 272 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  49.42 
 
 		 293 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.98 
 
 		 284 aa  262  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.98 
 
 		 284 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  48.34 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.82 
 
 		 275 aa  257  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.33 
 
 		 289 aa  251  7e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  50.78 
 
 		 282 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  49.08 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  47.62 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  47.62 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  47.62 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  47.62 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.71 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  44.85 
 
 		 274 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.63 
 
 		 284 aa  248  6e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 		 274 aa  248  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  47.25 
 
 		 273 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  46.89 
 
 		 273 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  48.16 
 
 		 277 aa  244  9e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  47.48 
 
 		 278 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  45.91 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  47.46 
 
 		 275 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  47.78 
 
 		 272 aa  241  9e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  46.3 
 
 		 269 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  50.2 
 
 		 285 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  47.41 
 
 		 273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  48.53 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  48.72 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  44.32 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  43.96 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.88 
 
 		 287 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.83 
 
 		 292 aa  171  9e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 		 287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  35.96 
 
 		 283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  35.97 
 
 		 263 aa  149  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.09 
 
 		 240 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.29 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.14 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  34.64 
 
 		 236 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.93 
 
 		 246 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  30.61 
 
 		 269 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1811  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 268 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.271129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.296993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 		 298 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.95 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 		 295 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03190  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.86 
 
 		 255 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 		 235 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.02 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 		 354 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.718494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3932  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.84 
 
 		 268 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  29.82 
 
 		 262 aa  95.9  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0060  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 		 293 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.116516  normal  0.834143 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.02 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.59 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.06 
 
 		 272 aa  94  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1292  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 		 339 aa  93.2  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.48 
 
 		 295 aa  93.6  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 268 aa  93.2  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 		 297 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 		 335 aa  92.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000556089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 		 317 aa  92  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 308 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.278854  normal  0.143787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.99 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  29.58 
 
 		 265 aa  92  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 258 aa  92  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 		 285 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>