More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2554 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
284 aa  572  1.0000000000000001e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44197  normal  0.213043 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  71.13 
 
 
284 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  71.89 
 
 
284 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  71.89 
 
 
284 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13251  short chain dehydrogenase  71.22 
 
 
282 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.922859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4014  short chain dehydrogenase  73.02 
 
 
284 aa  408  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0877933  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1776  short chain dehydrogenase  69.42 
 
 
281 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.306101  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4691  short chain dehydrogenase  70.5 
 
 
281 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0951384  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  62.28 
 
 
293 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0020  short chain dehydrogenase  61.57 
 
 
298 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0025  short chain dehydrogenase  62.95 
 
 
291 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0723  short chain dehydrogenase  61.21 
 
 
293 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.07 
 
 
284 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.59 
 
 
279 aa  354  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.35 
 
 
284 aa  350  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67123  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  62.45 
 
 
280 aa  349  3e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5258  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.66 
 
 
272 aa  348  5e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.01 
 
 
289 aa  346  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.57 
 
 
284 aa  343  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.3 
 
 
289 aa  343  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307947  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25480  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  61.76 
 
 
274 aa  341  9e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.55 
 
 
275 aa  336  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5502  short chain dehydrogenase  58.3 
 
 
271 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0688  short chain dehydrogenase  58.78 
 
 
285 aa  332  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3813  short chain dehydrogenase  58.76 
 
 
285 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.186158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3827  short chain dehydrogenase  58.76 
 
 
285 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3901  short chain dehydrogenase  58.76 
 
 
285 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3760  short chain dehydrogenase  61.62 
 
 
273 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.601387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3816  short chain dehydrogenase  60.89 
 
 
273 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.651668  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3900  short chain dehydrogenase  60.52 
 
 
273 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3873  short chain dehydrogenase  59.19 
 
 
273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1337  short chain dehydrogenase  53.9 
 
 
269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1306  short chain dehydrogenase  57.72 
 
 
277 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1333  short chain dehydrogenase  53.16 
 
 
269 aa  304  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1282  short chain dehydrogenase  57.04 
 
 
296 aa  302  5.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3295  short chain dehydrogenase  56.62 
 
 
272 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2386  short chain dehydrogenase  53.31 
 
 
286 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1326  short chain dehydrogenase  56.16 
 
 
295 aa  299  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000371918 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26650  short chain dehydrogenase  54.01 
 
 
274 aa  298  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.999044  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4262  short chain dehydrogenase  52.35 
 
 
289 aa  296  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2262  short chain dehydrogenase  53.65 
 
 
274 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2695  short chain dehydrogenase  51.82 
 
 
274 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18208  normal  0.175359 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3931  short chain dehydrogenase  53.96 
 
 
275 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5211  short chain dehydrogenase  48 
 
 
274 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00876226 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0413  short chain dehydrogenase  55.96 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0685563  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  51.65 
 
 
274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 
290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.265278  normal  0.13517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.41 
 
 
287 aa  214  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0668382  normal  0.810998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.01 
 
 
292 aa  185  7e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
287 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2352  short chain dehydrogenase  39.42 
 
 
283 aa  175  7e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0218125 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  40.53 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3802  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
246 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.805429  normal  0.439717 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
246 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.317605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3871  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
246 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
287 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.69 
 
 
246 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
295 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
240 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00293136  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 
295 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4407  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.75 
 
 
268 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 
295 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3769  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.78 
 
 
259 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.988142 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 
295 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3481  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.76 
 
 
259 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187301  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.8 
 
 
253 aa  102  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
235 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
248 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
255 aa  98.6  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
260 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0856729  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  24.9 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
245 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2261  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
260 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00824711  normal  0.0431071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
309 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
246 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
266 aa  96.3  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  28.29 
 
 
252 aa  96.3  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 
257 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 
245 aa  95.9  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
282 aa  95.9  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1863  glucose 1-dehydrogenase  30.46 
 
 
269 aa  95.5  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 
295 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
261 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.64 
 
 
249 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3486  short chain dehydrogenase  34.03 
 
 
247 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
256 aa  93.6  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.2 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.12 
 
 
249 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.15 
 
 
259 aa  93.6  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
254 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
268 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.430043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
268 aa  92.8  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.233073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>