More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3486 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3486  short chain dehydrogenase  100 
 
 
247 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425497  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3874  short chain dehydrogenase  84.15 
 
 
256 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.122974  normal  0.933314 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5382  short chain dehydrogenase  72.47 
 
 
247 aa  345  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.712878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5033  short chain dehydrogenase  72.76 
 
 
253 aa  341  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3860  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  67.62 
 
 
249 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.840744  normal  0.0763537 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  67.62 
 
 
249 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.596689 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.06 
 
 
249 aa  328  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1852  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  67.62 
 
 
249 aa  328  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.454003  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1753  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  64.61 
 
 
248 aa  323  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2097  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  63.79 
 
 
249 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1892  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  63.79 
 
 
249 aa  322  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.362841  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  66.39 
 
 
249 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02300  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  67.07 
 
 
250 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.257704  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0262  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  66.67 
 
 
250 aa  295  7e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.520001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4227  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.69 
 
 
249 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4359  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.69 
 
 
249 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2813  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.28 
 
 
254 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0112  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.69 
 
 
249 aa  288  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.16629  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4155  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.69 
 
 
249 aa  288  7e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
251 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
251 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
251 aa  279  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3245  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.15 
 
 
246 aa  271  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.73 
 
 
246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.25 
 
 
248 aa  265  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.364281 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3141  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.61 
 
 
246 aa  261  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.08 
 
 
248 aa  261  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.933884  hitchhiker  0.00557136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.79 
 
 
246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.92 
 
 
248 aa  255  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.07 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2058  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.26 
 
 
246 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.66 
 
 
248 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424016  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
261 aa  247  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.01 
 
 
248 aa  247  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.264822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.5 
 
 
250 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.805502  normal  0.135775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 
247 aa  242  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.92 
 
 
246 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.92 
 
 
246 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1133  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
247 aa  238  9e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
248 aa  237  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881664  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5711  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.08 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
242 aa  228  8e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.162466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.59 
 
 
246 aa  226  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3419  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.24 
 
 
246 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.184809  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0085  oxidoreductase  50.2 
 
 
237 aa  225  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.689145  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1798  oxidoreductase  49.8 
 
 
237 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0401257  normal  0.0380539 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1291  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.75 
 
 
246 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.202973  normal  0.995742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 
246 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.289767  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.59 
 
 
249 aa  224  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000373028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0456  short-chain dehydrogenase  48.97 
 
 
243 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.25 
 
 
245 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.155975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0905  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.5 
 
 
246 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122722  normal  0.0656338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.36 
 
 
253 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1476  oxidoreductase  49.39 
 
 
237 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5464  short-chain dehydrogenase  49.58 
 
 
243 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0590758 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1860  oxidoreductase  48.98 
 
 
237 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.5 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.742025 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1800  oxidoreductase  50 
 
 
237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.419385 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31000  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.58 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4505  oxidoreductase  48.97 
 
 
237 aa  219  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.406489  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1657  oxidoreductase  50 
 
 
237 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.17128 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04116  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  48.97 
 
 
237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.97 
 
 
237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3763  oxidoreductase  48.97 
 
 
237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4821  oxidoreductase  48.97 
 
 
237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04080  hypothetical protein  48.97 
 
 
237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.92 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.38 
 
 
247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189407 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3612  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 
246 aa  218  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0158219  normal  0.051875 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2294  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.5 
 
 
246 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5771  oxidoreductase  48.56 
 
 
237 aa  217  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.79 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.73 
 
 
247 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4729  oxidoreductase  47.74 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4835  oxidoreductase  47.74 
 
 
237 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0121  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.79 
 
 
246 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521218  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0957  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
248 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.97 
 
 
248 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332665  normal  0.273672 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.21 
 
 
243 aa  206  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.37322  normal  0.510566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.15 
 
 
245 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802156  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.21 
 
 
246 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.61 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.219783 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.72 
 
 
248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00988774  normal  0.397771 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2597  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.16 
 
 
248 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2392  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.36 
 
 
255 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.432373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2966  oxidoreductase  48.58 
 
 
237 aa  184  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.959173  normal  0.0725779 
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  46.09 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  40.89 
 
 
247 aa  181  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
247 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.68 
 
 
254 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.68 
 
 
254 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
250 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
246 aa  174  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.17 
 
 
269 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.49 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
247 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.89 
 
 
262 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
265 aa  171  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>