More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3030 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
305 aa  631  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.62 
 
 
308 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.4 
 
 
309 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  63.25 
 
 
308 aa  381  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  59.74 
 
 
304 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  62.67 
 
 
304 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  59.34 
 
 
314 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  58.82 
 
 
304 aa  363  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  59.33 
 
 
303 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  58.59 
 
 
304 aa  359  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  58.94 
 
 
303 aa  359  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.06 
 
 
304 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  57.1 
 
 
305 aa  349  3e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.88 
 
 
304 aa  348  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  58.94 
 
 
303 aa  348  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  60.07 
 
 
298 aa  335  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  57.95 
 
 
550 aa  334  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  54.82 
 
 
304 aa  332  6e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  54.97 
 
 
351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.49 
 
 
303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.54 
 
 
293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.1 
 
 
303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.5 
 
 
307 aa  295  6e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  48.68 
 
 
315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
304 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 
308 aa  281  1e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  51.19 
 
 
307 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
302 aa  276  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  50.51 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  50.51 
 
 
307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.86 
 
 
298 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
283 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.45 
 
 
279 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
287 aa  149  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.31 
 
 
283 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
290 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 
291 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
284 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
324 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
324 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.66 
 
 
286 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.75 
 
 
280 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
288 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  30.79 
 
 
334 aa  121  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
287 aa  119  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
327 aa  116  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.03 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
288 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 
291 aa  106  5e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
286 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.09 
 
 
277 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  32.27 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
268 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2380  gluconate 5-dehydrogenase  32.2 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667021  decreased coverage  0.0022048 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2136  gluconate 5-dehydrogenase  31.71 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510387  normal  0.0477177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.81 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  27.84 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  27.84 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
280 aa  77  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_6391  predicted protein  29.39 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000576275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2396  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.74 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000542518  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2466  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.74 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000110753  hitchhiker  0.00140528 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2558  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.74 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000120967  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.1 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.157395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2776  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.37 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  28.57 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.17 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.3 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2573  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.89 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000159991  hitchhiker  0.00324451 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1719  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.89 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131365  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1716  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.89 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000469264  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.06 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1499  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.24 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000126797  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1759  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.89 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000535211  normal  0.457957 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1582  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.1 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000004002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2829  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.150517  normal  0.215397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2785  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.91 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  27.23 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1850  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  29.44 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00172962  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2293  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.24 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000712528  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  28.36 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  26.34 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4355  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.901816  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  28.64 
 
 
255 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  29.81 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1187  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.16 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.206395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  29.13 
 
 
255 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>