More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1260 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
286 aa  580  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.32 
 
 
287 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.32 
 
 
287 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.32 
 
 
287 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.2 
 
 
287 aa  298  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.87 
 
 
288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.34 
 
 
268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.44 
 
 
270 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.44 
 
 
270 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.44 
 
 
270 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.35 
 
 
288 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.02 
 
 
272 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.14 
 
 
291 aa  258  1e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.06 
 
 
324 aa  195  9e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 
324 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
322 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 
327 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  39.6 
 
 
334 aa  176  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.56 
 
 
279 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
277 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
298 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  36.67 
 
 
304 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
304 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
293 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
307 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 
304 aa  132  7.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
309 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  34.93 
 
 
303 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  33.22 
 
 
304 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  34.65 
 
 
307 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  34.69 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  34.04 
 
 
304 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  34.22 
 
 
307 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  33.45 
 
 
305 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 
308 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 
303 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.5 
 
 
303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 
308 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  32.43 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  35.49 
 
 
298 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  32.66 
 
 
351 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
304 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
302 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
305 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
303 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  30.83 
 
 
550 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
290 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
283 aa  100  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.82 
 
 
287 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.74 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.66 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
283 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_12103  predicted protein  32.94 
 
 
273 aa  92.4  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.932364  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  31.63 
 
 
272 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  27.45 
 
 
272 aa  87.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  31.63 
 
 
272 aa  87  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 
270 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.52 
 
 
246 aa  85.5  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0934  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.03 
 
 
247 aa  85.5  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00491532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.86 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1857  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
251 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000512545 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.3 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.98 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  33.01 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  32.22 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04781  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  29.8 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  32.93 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0022  short chain dehydrogenase  27.01 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  33.01 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3106  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.45 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000229278  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  33.01 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.34 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.282253  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1463  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.5 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.619727  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0453  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.37 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2203  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.424869  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05091  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  28.37 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2308  putative 3-oxoacyl-ACP reductase  31.98 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.03 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1399  short chain dehydrogenase  27.24 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319631  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1365  short chain dehydrogenase  27.24 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1383  short chain dehydrogenase  27.24 
 
 
284 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  33.01 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  33.01 
 
 
255 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.44 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2808  short chain dehydrogenase  27.61 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.61 
 
 
246 aa  79  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.02 
 
 
247 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>