More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0336 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
304 aa  628  1e-179  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.17 
 
 
307 aa  529  1e-149  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
293 aa  351  8.999999999999999e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.8 
 
 
303 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58 
 
 
303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.25 
 
 
304 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  58.12 
 
 
298 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
308 aa  308  9e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  53.49 
 
 
304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  53.51 
 
 
303 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  51.31 
 
 
304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  53.42 
 
 
308 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  51.5 
 
 
304 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  53.18 
 
 
314 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.11 
 
 
302 aa  297  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  52.82 
 
 
304 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  51.64 
 
 
305 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.33 
 
 
309 aa  289  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  50.16 
 
 
303 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  52.51 
 
 
303 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.97 
 
 
305 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.08 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  48.87 
 
 
307 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  48.87 
 
 
307 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  49.35 
 
 
307 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  47.24 
 
 
315 aa  268  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  48.56 
 
 
351 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  49.83 
 
 
550 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.34 
 
 
298 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  46.05 
 
 
304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 
290 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.14 
 
 
279 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.26 
 
 
283 aa  168  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
287 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
322 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
286 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.46 
 
 
324 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.12 
 
 
324 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
284 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.33 
 
 
280 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
291 aa  146  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  32.79 
 
 
334 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
288 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
287 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
287 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
287 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 
287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 
286 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 
291 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 
268 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
270 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
270 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
270 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 
272 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.63 
 
 
256 aa  89  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 
248 aa  85.9  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
295 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  29.28 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
295 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.04 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.04 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.62 
 
 
280 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
254 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
254 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6420  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.54 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.497149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.06102  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2647  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.25 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000389723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  27.41 
 
 
252 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2084  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.51 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558768  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.86 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.092297  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.13 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  26.77 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0684  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.77 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4406  1,6-dihydroxycyclohexa-2,4-diene-1-carboxylate dehydrogenase  30.32 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  30.97 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04781  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  28.21 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05091  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  28.21 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.38 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.78 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>