More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3687 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.36 
 
 
288 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.09 
 
 
287 aa  259  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
288 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
287 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
287 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
287 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.67 
 
 
324 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.02 
 
 
324 aa  234  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.25 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.62 
 
 
291 aa  233  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
322 aa  227  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.8 
 
 
268 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.87 
 
 
279 aa  209  5e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.79 
 
 
298 aa  201  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.88 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  39.6 
 
 
334 aa  192  5e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.29 
 
 
272 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
277 aa  181  9.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 
304 aa  163  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.42 
 
 
304 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
308 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
307 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 
304 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
293 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  37.32 
 
 
304 aa  149  8e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  37.97 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 
307 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 
307 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  35.13 
 
 
304 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 
307 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 
303 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  36.59 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  35.64 
 
 
314 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  34.66 
 
 
305 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
308 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  34.41 
 
 
304 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.81 
 
 
304 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
303 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  34.01 
 
 
351 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.66 
 
 
305 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  35.14 
 
 
550 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.65 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
291 aa  117  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
283 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
283 aa  115  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  31.25 
 
 
315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
287 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 
280 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 
295 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
262 aa  102  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.43 
 
 
284 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.98 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 
256 aa  99.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4556  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.67 
 
 
295 aa  99  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.96 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0470  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.65 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000863447  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2394  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
270 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.883346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
295 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.7 
 
 
246 aa  96.3  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 
268 aa  95.9  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 
255 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 
255 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.6 
 
 
256 aa  95.5  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000512545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.82 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  33.96 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  33.49 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
295 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.79 
 
 
255 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.64 
 
 
246 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  32.44 
 
 
253 aa  93.2  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3155  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  32 
 
 
254 aa  93.2  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  33.49 
 
 
255 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  32.3 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  33.03 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.58 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.69 
 
 
247 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  32.26 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.83 
 
 
247 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
254 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
257 aa  90.1  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
249 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2071  short chain dehydrogenase  30.63 
 
 
256 aa  90.1  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1573  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  33.33 
 
 
266 aa  89.4  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.647658  normal  0.48808 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16540  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  33.49 
 
 
280 aa  89  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0453  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  27.34 
 
 
249 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.465318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>