More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2630 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
322 aa  660    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.34 
 
 
324 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.72 
 
 
324 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.43 
 
 
327 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  41.37 
 
 
334 aa  233  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
286 aa  227  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.43 
 
 
279 aa  205  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 
288 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 
287 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.42 
 
 
287 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 
287 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 
287 aa  197  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 
298 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.6 
 
 
288 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
286 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
304 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
307 aa  159  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 
270 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 
270 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 
270 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
268 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.37 
 
 
272 aa  150  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 
308 aa  146  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  32.76 
 
 
303 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 
303 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  33.45 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  31.07 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  33.56 
 
 
298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.9 
 
 
309 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
303 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  30.56 
 
 
304 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 
307 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 
307 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  32.32 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 
303 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  32.32 
 
 
304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
302 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
290 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 
283 aa  122  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  30 
 
 
351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
283 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  32.04 
 
 
550 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.39 
 
 
304 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.11 
 
 
287 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.03 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  28.72 
 
 
315 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
284 aa  105  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  31.5 
 
 
272 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  33.81 
 
 
252 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
262 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.97 
 
 
248 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.21 
 
 
248 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2549  short chain dehydrogenase  31.54 
 
 
272 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2499  short chain dehydrogenase  31.54 
 
 
272 aa  92  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.496805  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
247 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  31.48 
 
 
249 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.09 
 
 
255 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.45 
 
 
247 aa  89.7  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1909  short chain dehydrogenase  30.62 
 
 
255 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.569755  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
280 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3600  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
287 aa  89  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181549  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
255 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3926  short chain dehydrogenase  30.62 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411324  normal  0.0487597 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.2 
 
 
299 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1490  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.41 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.173675  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.39 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3560  short chain dehydrogenase  30.62 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.457145  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5538  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
255 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00687705  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.32 
 
 
265 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.07 
 
 
251 aa  87  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.61 
 
 
245 aa  87  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1060  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  32.72 
 
 
250 aa  86.3  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000409861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0470  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  30.09 
 
 
249 aa  86.3  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000863447  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0344  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  30.83 
 
 
258 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.16 
 
 
255 aa  86.3  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0966  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 
251 aa  86.3  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1088  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.18 
 
 
250 aa  85.9  9e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.885603  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1277  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  32.26 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.038158  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
280 aa  85.5  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.11166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.192229  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.38 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.783199  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.5 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 
264 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.616501 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1671  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.49 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2097  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  34.78 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0368454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>