More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2781 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  100 
 
 
307 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  98.37 
 
 
307 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  98.37 
 
 
307 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  72.08 
 
 
351 aa  424  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.2 
 
 
308 aa  410  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  60.47 
 
 
304 aa  345  8e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  60.47 
 
 
304 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  60.87 
 
 
308 aa  340  1e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.14 
 
 
308 aa  338  8e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  58.45 
 
 
304 aa  332  5e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.92 
 
 
309 aa  329  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  58.72 
 
 
304 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  57.43 
 
 
303 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  56.23 
 
 
303 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  56.76 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  56.76 
 
 
305 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  57.77 
 
 
303 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.41 
 
 
304 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  56.31 
 
 
550 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.92 
 
 
304 aa  278  8e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 
305 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  55.82 
 
 
298 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  50 
 
 
304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.35 
 
 
307 aa  271  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.35 
 
 
304 aa  268  1e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.67 
 
 
303 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
303 aa  255  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.05 
 
 
293 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  47.12 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.14 
 
 
302 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.67 
 
 
298 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.42 
 
 
283 aa  152  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.8 
 
 
284 aa  149  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.42 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
287 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
286 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.72 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.2 
 
 
279 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
288 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 
287 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34 
 
 
324 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
324 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
322 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
286 aa  124  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  30.99 
 
 
334 aa  122  7e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.67 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.72 
 
 
327 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.78 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.14 
 
 
277 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.08 
 
 
268 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
270 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
270 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
270 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.51 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.04 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.84 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.982216  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.84 
 
 
239 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.83 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  27.23 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  25.48 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.15 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.04 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
295 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.26 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  27.15 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  28.5 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.64 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
251 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1935  putative short-chain alcohol dehydrogenase  31.22 
 
 
267 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000230306  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.64 
 
 
254 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0672528  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.34 
 
 
253 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260507  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3848  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  23.11 
 
 
263 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
268 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6983  short chain dehydrogenase  27.52 
 
 
261 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.129744  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.71 
 
 
250 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.71 
 
 
250 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.49 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.45 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  0.250737 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.48 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.83 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.68 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.84 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  27.52 
 
 
258 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.75 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>