More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1762 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.99 
 
 
241 aa  203  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
241 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
252 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.82 
 
 
263 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.41 
 
 
270 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 
242 aa  185  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  44.54 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.66 
 
 
250 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.05 
 
 
247 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.44 
 
 
244 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
246 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
245 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
260 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.32 
 
 
246 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.53 
 
 
231 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  41.22 
 
 
257 aa  158  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.16 
 
 
249 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
250 aa  155  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
245 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.31 
 
 
232 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  42.06 
 
 
244 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.7 
 
 
257 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
244 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
238 aa  145  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
250 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
239 aa  142  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
246 aa  141  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.66 
 
 
229 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 
236 aa  138  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
237 aa  138  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
236 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  36.14 
 
 
236 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  34.94 
 
 
236 aa  135  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.91 
 
 
248 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.03 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  37.1 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.37 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
248 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.08 
 
 
237 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
243 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
234 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
234 aa  122  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  35.55 
 
 
309 aa  119  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0396  carbonyl reductase  35.09 
 
 
243 aa  115  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  34.82 
 
 
242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 
240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.33 
 
 
244 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  38.76 
 
 
245 aa  109  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17920  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  34.78 
 
 
251 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.355358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0994  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 
247 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0983572  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 
277 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  33.49 
 
 
254 aa  102  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
243 aa  101  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000379715  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.28 
 
 
264 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
247 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.188551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.93 
 
 
244 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
246 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
246 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.63 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
245 aa  99  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.679351  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
285 aa  99.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
256 aa  99  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2451  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
247 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  32.14 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1421  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.71 
 
 
251 aa  97.8  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  31.28 
 
 
254 aa  97.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1835  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.93 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0909527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  33.17 
 
 
264 aa  96.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
236 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2486  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.68 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.38654  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
236 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.95 
 
 
251 aa  96.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.48 
 
 
247 aa  96.3  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.264049  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2494  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.74 
 
 
248 aa  96.3  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000082608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0123285 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0141  carbonyl reductase  32.85 
 
 
245 aa  96.3  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2241  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.15 
 
 
245 aa  95.9  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000319418  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
248 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  31.68 
 
 
263 aa  95.5  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  35.55 
 
 
363 aa  94.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  35.55 
 
 
363 aa  94.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>