More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0413 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
243 aa  478  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 
233 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.87 
 
 
227 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
238 aa  139  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  37.86 
 
 
257 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
244 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 
237 aa  131  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.16 
 
 
238 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
239 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  37.04 
 
 
245 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.1 
 
 
245 aa  128  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
244 aa  126  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.93 
 
 
244 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
248 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
251 aa  122  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.17 
 
 
248 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.04 
 
 
245 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
229 aa  118  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
252 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
250 aa  118  9e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
229 aa  116  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
265 aa  114  8.999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.12 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  39.39 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 
236 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  31.22 
 
 
236 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  29.86 
 
 
236 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  29.86 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
250 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
260 aa  109  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 
272 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 
263 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 
241 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 
254 aa  106  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
245 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
246 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.51 
 
 
250 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  38.71 
 
 
244 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
246 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
249 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0751362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
270 aa  99  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6224  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
255 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000552131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.62 
 
 
268 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  32.32 
 
 
258 aa  95.5  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.5 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
257 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0864  short chain dehydrogenase  30.5 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1041  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0420142  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.667413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.78 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  32 
 
 
256 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.03 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
236 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
244 aa  93.2  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3502  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
247 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.78 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0426  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
253 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0324644 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  30.3 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0452  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.57 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.53 
 
 
253 aa  92.4  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00663805  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
254 aa  92.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
250 aa  92  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
255 aa  92  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
249 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0445  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.57 
 
 
246 aa  92  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  30.3 
 
 
255 aa  92  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0732  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.81 
 
 
249 aa  92  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
239 aa  92  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.640458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
257 aa  92  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2456  short chain dehydrogenase  30.81 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2639  short chain dehydrogenase  35 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.83 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2681  short chain dehydrogenase  35 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2451  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.38 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2811  short chain dehydrogenase  35 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2590  short chain dehydrogenase  35 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2705  short chain dehydrogenase  35 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.856225  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3305  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.27 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1006  short chain dehydrogenase  30.35 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0117  acetoin reductase  32.32 
 
 
258 aa  89.4  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.713741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3419  short chain dehydrogenase  30.3 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.689572  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
233 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.604748  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02553  hypothetical protein  35.71 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>