More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3154 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
232 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  72.17 
 
 
231 aa  298  4e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.16 
 
 
231 aa  285  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.34 
 
 
237 aa  208  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.58 
 
 
234 aa  207  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.58 
 
 
234 aa  207  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  47.26 
 
 
244 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 
249 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.31 
 
 
251 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.86 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
245 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.95 
 
 
250 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.95 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
260 aa  154  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.27 
 
 
246 aa  153  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.8 
 
 
246 aa  148  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.91 
 
 
270 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.66 
 
 
237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.18 
 
 
252 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.68 
 
 
263 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.72 
 
 
245 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
241 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.56 
 
 
247 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.92 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  40 
 
 
240 aa  137  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.42 
 
 
244 aa  134  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  37.87 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
245 aa  131  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.94 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  38.31 
 
 
245 aa  128  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  32.08 
 
 
236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.18 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  32.5 
 
 
236 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  31.67 
 
 
236 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  32.5 
 
 
236 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
244 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.26 
 
 
250 aa  122  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.76 
 
 
238 aa  122  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.4 
 
 
227 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.12 
 
 
238 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  34.44 
 
 
257 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
236 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0396  carbonyl reductase  34.29 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.91 
 
 
229 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
240 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  31.71 
 
 
309 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.19 
 
 
248 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
272 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
229 aa  104  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 
307 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.958738  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5911  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.71 
 
 
307 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.14 
 
 
307 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.36 
 
 
248 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
266 aa  101  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  36.18 
 
 
270 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00525  conserved hypothetical protein  31.98 
 
 
263 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.83 
 
 
239 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 
272 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  37.24 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.47 
 
 
271 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
271 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
279 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
285 aa  95.5  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  27.46 
 
 
242 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.15 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
268 aa  94  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  34.02 
 
 
286 aa  94  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  33.68 
 
 
272 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
268 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 
271 aa  93.6  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  32.8 
 
 
304 aa  93.2  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  35.9 
 
 
270 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  36.14 
 
 
302 aa  92.8  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  41.04 
 
 
279 aa  92.4  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1945  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
227 aa  92.4  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3107  short-chain alcohol-related dehydrogenase  31.79 
 
 
272 aa  92  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
271 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
269 aa  91.3  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5364  short chain dehydrogenase  35.79 
 
 
270 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.63 
 
 
273 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
248 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1464  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.31 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.305305  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2451  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 
247 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.26523  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  34.38 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
273 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
275 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.18 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0345  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.94 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.35 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
269 aa  89.4  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
271 aa  89  6e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
247 aa  89  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.264049  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4780  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
227 aa  89  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>