More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2451 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
241 aa  473  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.16 
 
 
270 aa  322  3e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.7 
 
 
241 aa  303  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.4 
 
 
247 aa  291  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.99 
 
 
251 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.77 
 
 
263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.31 
 
 
238 aa  194  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.57 
 
 
239 aa  192  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.69 
 
 
244 aa  191  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
242 aa  188  7e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
238 aa  183  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.68 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 
245 aa  178  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.86 
 
 
229 aa  178  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  43.62 
 
 
240 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
260 aa  170  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  46.59 
 
 
244 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.35 
 
 
246 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
245 aa  170  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
233 aa  170  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
250 aa  169  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
234 aa  168  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 
234 aa  168  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.17 
 
 
248 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.57 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
249 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  39.52 
 
 
245 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.97 
 
 
227 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
246 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  40 
 
 
257 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
250 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
229 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.74 
 
 
244 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
245 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
272 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.28 
 
 
237 aa  148  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
231 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.57 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
236 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
236 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  32.78 
 
 
236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  32.78 
 
 
236 aa  138  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
248 aa  138  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.39 
 
 
237 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
239 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
250 aa  135  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.83 
 
 
240 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.13 
 
 
236 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.91 
 
 
232 aa  133  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.98 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
236 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  35.95 
 
 
309 aa  121  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.14 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01679  20-beta-hydroxysteroid dehydrogenase  33.06 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.774728  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
235 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  35.08 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  34.18 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.76 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
232 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44630  predicted protein  31.34 
 
 
277 aa  109  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0847345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
252 aa  107  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.71 
 
 
246 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.71 
 
 
246 aa  107  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.41 
 
 
269 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
254 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.799434 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  34.98 
 
 
254 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
252 aa  105  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.07 
 
 
254 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.496264  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  34.88 
 
 
264 aa  105  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  32.61 
 
 
251 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  33.18 
 
 
263 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.18 
 
 
255 aa  103  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0490  gluconate 5-dehydrogenase  33.33 
 
 
265 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  33.01 
 
 
263 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  33.85 
 
 
262 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.39 
 
 
254 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  0.250737 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1540  gluconate 5-dehydrogenase  34.1 
 
 
255 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0166996  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.44 
 
 
258 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.143319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  37.82 
 
 
286 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0141  carbonyl reductase  33.79 
 
 
245 aa  101  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0797  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.35 
 
 
244 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13073  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein  32.02 
 
 
253 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  32.86 
 
 
257 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.41 
 
 
251 aa  99.8  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1335  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 
256 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4824  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1235  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 
256 aa  99.4  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0973  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 
256 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  38.07 
 
 
276 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0594  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 
256 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.512344  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0318  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 
256 aa  99.4  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.594764  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.191543  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2495  short chain dehydrogenase  37.06 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
259 aa  99  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0794985  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.8 
 
 
255 aa  99  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>