More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2793 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0794985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.93 
 
 
261 aa  358  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.7 
 
 
261 aa  344  8e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0761637  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1221  ketoacyl reductase  67.97 
 
 
261 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.432142  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.6 
 
 
275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.78 
 
 
258 aa  290  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.43 
 
 
186 aa  207  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
266 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.800927  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1682  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.89 
 
 
260 aa  175  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3915  acetoacetyl-CoA reductase  39.22 
 
 
252 aa  175  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8088  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  43.3 
 
 
277 aa  171  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.62 
 
 
247 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2275  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
254 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0631  acetoacetyl-CoA reductase  39.39 
 
 
246 aa  169  4e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23650  Acetoacetl-CoA reductase in PHB biosynthesis  38.52 
 
 
247 aa  167  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4500  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  39.06 
 
 
258 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0782266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0422  sorbitol-6-phosphate dehydrogenase  40.39 
 
 
265 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0026318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2848  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.31 
 
 
246 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.64 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.64 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
246 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
246 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.19 
 
 
244 aa  164  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.13 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2625  acetoacetyl-CoA reductase  36.58 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3207  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 
246 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.819769  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1081  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.86 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.46401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
246 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
246 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
246 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
246 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000520  acetoacetyl-CoA reductase  37.88 
 
 
246 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.7 
 
 
246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
254 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
246 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.1 
 
 
246 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5895  acetoacetyl-CoA reductase  38.08 
 
 
248 aa  161  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.210588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.27 
 
 
246 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05365  acetoacetyl-CoA reductase  37.84 
 
 
268 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1438  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.67 
 
 
245 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1131  acetoacetyl-CoA reductase  39.53 
 
 
248 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.735079  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3122  acetoacetyl-CoA reductase  38.19 
 
 
246 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.868541  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
257 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1519  acetoacetyl-CoA reductase  41.41 
 
 
247 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.004615  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0943  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.46 
 
 
246 aa  159  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000752112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.3 
 
 
248 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0240  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.89 
 
 
261 aa  158  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.67492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
254 aa  158  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0694225  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3106  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.87 
 
 
246 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000229278  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
260 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.136099 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3832  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 
260 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.919217  normal  0.496442 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0435  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.83 
 
 
238 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0971  acetyacetyl-CoA reductase  36.22 
 
 
246 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.438237  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.49 
 
 
246 aa  156  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1531  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.45 
 
 
249 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356437 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0281  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  39.76 
 
 
257 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1358  acetyacetyl-CoA reductase  35.83 
 
 
246 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0701  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.78 
 
 
247 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000555171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.57 
 
 
251 aa  155  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
264 aa  155  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.37 
 
 
246 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.62 
 
 
247 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0826  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.28 
 
 
266 aa  155  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.162966  hitchhiker  0.000570032 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00406  acetoacetyl-CoA reductase  42.23 
 
 
246 aa  155  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1609  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.74 
 
 
246 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.481338 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4347  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.39 
 
 
247 aa  155  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.296553  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.72 
 
 
262 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1576  putative D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase (BDH) oxidoreductase protein  37.6 
 
 
260 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1951  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.53 
 
 
247 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262535 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1485  acetyacetyl-CoA reductase  35.83 
 
 
246 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.050583  normal  0.0314041 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1585  acetyacetyl-CoA reductase  35.83 
 
 
246 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.633023  normal  0.0323128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
246 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
254 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4287  acetoacetyl-CoA reductase  36.92 
 
 
248 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.250358  normal  0.289691 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2031  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.55 
 
 
245 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1914  acetyacetyl-CoA reductase  35.83 
 
 
246 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.263338  normal  0.044907 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2001  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.84 
 
 
245 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.98 
 
 
246 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.72 
 
 
258 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.25 
 
 
252 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3729  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.57 
 
 
258 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3935  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.58 
 
 
249 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.72 
 
 
258 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4724  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
273 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1997  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.13 
 
 
259 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2000  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.13 
 
 
259 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
250 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.117153  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2561  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
241 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00191799  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3819  acetoacetyl-CoA reductase  36.54 
 
 
248 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  normal  0.774133 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  37.11 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0281  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.5 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0874808  normal  0.889529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1845  acetyacetyl-CoA reductase  35.43 
 
 
246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.142964 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.815314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.82 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.3 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0156103  normal  0.420839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1914  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.82 
 
 
246 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.225982  unclonable  0.00000025173 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1007  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.35 
 
 
247 aa  152  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0235176 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2341  acetyacetyl-CoA reductase  35.04 
 
 
246 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.0840076 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.92 
 
 
246 aa  152  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>