More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4780 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4780  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
227 aa  465  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.56 
 
 
226 aa  328  6e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.01 
 
 
228 aa  274  9e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.05 
 
 
246 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0902023 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 
236 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2308  short chain dehydrogenase  45.58 
 
 
235 aa  198  7e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3017  short chain dehydrogenase  45.13 
 
 
235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.493678 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
289 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
246 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  34.59 
 
 
276 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  34.97 
 
 
277 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 
239 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  35.33 
 
 
276 aa  109  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  34.05 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
244 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
239 aa  108  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  34.78 
 
 
277 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.75 
 
 
253 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.75 
 
 
253 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0521  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.8 
 
 
242 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000169063  hitchhiker  0.0028049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1561  short chain dehydrogenase  33.69 
 
 
516 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.636243  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  32.79 
 
 
277 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0516  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.8 
 
 
242 aa  107  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000197068  decreased coverage  0.00245828 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.98 
 
 
255 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.61 
 
 
238 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1719  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
249 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
277 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  34.05 
 
 
277 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  34.05 
 
 
277 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
281 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
246 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
244 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.11 
 
 
246 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4299  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.48 
 
 
291 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
257 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
282 aa  104  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.08 
 
 
248 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 
246 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2017  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.45 
 
 
248 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0115083  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.51 
 
 
246 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.51 
 
 
246 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.96 
 
 
258 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.86 
 
 
247 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
291 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5270  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.57 
 
 
248 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.69 
 
 
256 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
257 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32520  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR protein  33.66 
 
 
278 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
279 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
306 aa  103  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
339 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  30 
 
 
236 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 
266 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
264 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 
258 aa  102  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0609  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.08 
 
 
250 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000540972 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0457  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.85 
 
 
242 aa  102  6e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.741091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
291 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321588  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
249 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
291 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5405  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.89 
 
 
291 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403602  normal  0.010149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.41 
 
 
237 aa  101  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.87 
 
 
265 aa  101  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1421  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.1 
 
 
251 aa  101  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  32.98 
 
 
277 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
248 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  35.52 
 
 
278 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 
256 aa  100  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0899775  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1233  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.39 
 
 
251 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00223298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2851  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.8 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238755  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0532  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.8 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2905  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.8 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.901799  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2804  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.8 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
246 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0139206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
248 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672798  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
244 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
281 aa  100  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1800  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.8 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
285 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2790  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.8 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.570924  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.86 
 
 
246 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
249 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.68 
 
 
287 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2477  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.8 
 
 
249 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
276 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
283 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430451  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 
261 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002996  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  30.98 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000487281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.05 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1906  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.98 
 
 
244 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000158661  hitchhiker  0.0000072353 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
250 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1215  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.52 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.480399999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1472  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.52 
 
 
244 aa  99.4  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000346671  hitchhiker  0.00000000000000508287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 
282 aa  99.4  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
295 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0474  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.37 
 
 
254 aa  99.4  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>