More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3904 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
228 aa  463  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.76 
 
 
226 aa  278  6e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4780  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.01 
 
 
227 aa  274  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.3 
 
 
246 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0902023 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
236 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2308  short chain dehydrogenase  48.2 
 
 
235 aa  205  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3017  short chain dehydrogenase  47.3 
 
 
235 aa  201  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.493678 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0474  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.9 
 
 
254 aa  111  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  38.38 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  38.38 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  38.38 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.97 
 
 
243 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
276 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
281 aa  104  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1547  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
269 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.255418  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.77 
 
 
246 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
239 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
246 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
280 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
277 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1246  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.79 
 
 
248 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.245208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  35.42 
 
 
253 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  36.36 
 
 
246 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  38.5 
 
 
277 aa  101  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  36.79 
 
 
243 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
253 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
285 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  38.46 
 
 
276 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.55 
 
 
253 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
284 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 
253 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 
217 aa  99.8  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
276 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  36.76 
 
 
277 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1624  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  34.21 
 
 
252 aa  99  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.57 
 
 
274 aa  98.6  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0720968  normal  0.127644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
244 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33 
 
 
264 aa  98.6  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
243 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8648  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
282 aa  98.6  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.41 
 
 
249 aa  97.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3151  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
270 aa  97.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11649  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  36.07 
 
 
276 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
262 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.251558  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
289 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4325  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
244 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
261 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1421  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.73 
 
 
251 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1571  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  34.57 
 
 
243 aa  97.4  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
248 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0672798  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.65 
 
 
239 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
296 aa  96.3  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149437 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1867  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.16 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0330312  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  33 
 
 
239 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1586  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 
271 aa  96.3  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
264 aa  95.5  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  28.7 
 
 
236 aa  95.5  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.23 
 
 
247 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
267 aa  95.9  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0250  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.16 
 
 
240 aa  95.5  6e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.183431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.91 
 
 
276 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.0351935 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.51 
 
 
264 aa  95.1  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.51 
 
 
264 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.51 
 
 
264 aa  95.1  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.51 
 
 
264 aa  95.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  34.81 
 
 
279 aa  95.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.59 
 
 
257 aa  95.1  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  35.29 
 
 
278 aa  95.1  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
279 aa  95.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.016311  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2139  short chain dehydrogenase  34.44 
 
 
284 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.980351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  32.51 
 
 
264 aa  95.1  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0347  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 
289 aa  94.7  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  35.42 
 
 
253 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
287 aa  94.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  35.94 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2001  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.73 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  35.02 
 
 
253 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.46 
 
 
269 aa  94.7  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0712  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000308432  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
270 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41710  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.33 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 
282 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.51 
 
 
264 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
278 aa  94  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
293 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
306 aa  94  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.07 
 
 
239 aa  94  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
281 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.81 
 
 
276 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
275 aa  93.2  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.15 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>