More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0317 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
246 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0902023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.85 
 
 
226 aa  275  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.3 
 
 
228 aa  270  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4780  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.05 
 
 
227 aa  263  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2149  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348734  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2308  short chain dehydrogenase  46.96 
 
 
235 aa  208  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3017  short chain dehydrogenase  46.52 
 
 
235 aa  204  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.493678 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
244 aa  118  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  34.83 
 
 
253 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4537  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 
277 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6919  short chain dehydrogenase  32.17 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  33.83 
 
 
253 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.94 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 
279 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851419  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.15 
 
 
289 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
244 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1687  short chain dehydrogenase  35.33 
 
 
279 aa  108  8.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.19 
 
 
245 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1451  short chain dehydrogenase  31 
 
 
277 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6377  short chain dehydrogenase  31 
 
 
277 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
249 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  30.45 
 
 
236 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
248 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2007  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
276 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.372157  normal  0.691247 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7041  short chain dehydrogenase  30.57 
 
 
277 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.198805  normal  0.204999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
239 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
245 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5725  short chain dehydrogenase  31.33 
 
 
277 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.519964  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
339 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.51 
 
 
246 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.96 
 
 
246 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.66 
 
 
243 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2202  short chain dehydrogenase  32.4 
 
 
276 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516821  decreased coverage  0.00204142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
239 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
243 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6478  short chain dehydrogenase  29.87 
 
 
277 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0193628  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4325  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.79 
 
 
241 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
280 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1421  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.72 
 
 
251 aa  99.8  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
243 aa  99.8  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.88 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.03 
 
 
264 aa  99.4  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.11 
 
 
248 aa  99.4  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000401343  decreased coverage  0.000161546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.83 
 
 
245 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46420  short chain dehydrogenase  30.85 
 
 
277 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000350021  hitchhiker  0.000971378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0984  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 
283 aa  98.2  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 
287 aa  97.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.42 
 
 
239 aa  98.2  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2624  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.11 
 
 
248 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000523839  unclonable  0.000000000127004 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2001  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.8 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2500  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.96 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.71 
 
 
317 aa  97.4  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.9 
 
 
279 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.96 
 
 
250 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
244 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1074  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.93 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.91 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
275 aa  95.9  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 
264 aa  96.3  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.91 
 
 
257 aa  95.9  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09378  conserved hypothetical protein  32.04 
 
 
282 aa  95.9  6e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.141306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1270  Short-chain dehydrogenase  30.99 
 
 
248 aa  95.5  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0474  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.64 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.24 
 
 
239 aa  95.5  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 
277 aa  95.5  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.12 
 
 
244 aa  95.5  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  29.35 
 
 
255 aa  95.5  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8863  short chain dehydrogenase  32.24 
 
 
282 aa  95.5  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1645  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 
247 aa  95.1  8e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.633684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
276 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1588  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.57 
 
 
247 aa  95.1  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0299797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 
270 aa  95.1  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.32 
 
 
246 aa  95.1  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.32 
 
 
246 aa  95.1  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.49 
 
 
248 aa  94.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
249 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
239 aa  94.7  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.6 
 
 
274 aa  94.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.12295  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.53 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1719  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.55 
 
 
249 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  30.26 
 
 
303 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.85 
 
 
281 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.105583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.73 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 
248 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0136754  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 
240 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.59 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3972  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.5 
 
 
263 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.59 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0736  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
272 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2694  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.44 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140446  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.59 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.64 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  27.92 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5220  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
279 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0824  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.28 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.138701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>