More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0555 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
239 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4057  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.61 
 
 
239 aa  431  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  86.19 
 
 
239 aa  424  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  84.03 
 
 
243 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.853199  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4141  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  82.77 
 
 
243 aa  408  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  83.19 
 
 
243 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05303  oxidoreductase  67.78 
 
 
239 aa  343  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0184  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  66.11 
 
 
239 aa  333  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000420  oxidoreductase short-chain dehydrogenase/reductase family  65.69 
 
 
239 aa  332  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.637186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4937  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  63.6 
 
 
239 aa  328  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4325  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.29 
 
 
241 aa  300  9e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3264  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.29 
 
 
243 aa  284  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.138701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0916  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.29 
 
 
246 aa  281  7.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1571  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  52.92 
 
 
243 aa  251  1e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.37 
 
 
241 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.57 
 
 
242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.162516  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0250  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  41.77 
 
 
240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.183431  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0256  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.86 
 
 
239 aa  205  5e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.62 
 
 
248 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.93 
 
 
244 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.15 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.68 
 
 
244 aa  171  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
248 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0635  putative short-chain dehydrogenase/reductase  42.8 
 
 
246 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.660542  normal  0.0297002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
253 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
246 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
244 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.66 
 
 
244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 
245 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
247 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
244 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
244 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.67 
 
 
252 aa  156  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
264 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  38.68 
 
 
255 aa  155  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4381  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.33 
 
 
248 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  hitchhiker  0.00314525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
252 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 
240 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.197583  normal  0.684579 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  37.86 
 
 
252 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.19 
 
 
247 aa  152  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.340445  normal  0.365193 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
244 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0125509  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
244 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0588  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
247 aa  148  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.622721  normal  0.233653 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33490  short-chain alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 
247 aa  148  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.343117  normal  0.392445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  38.27 
 
 
245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
246 aa  146  3e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.07 
 
 
246 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4222  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
242 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.186526  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
249 aa  142  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.18 
 
 
317 aa  142  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.02 
 
 
249 aa  141  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  34.57 
 
 
1270 aa  139  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
245 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.21 
 
 
255 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0691518 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
254 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8710  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity-like protein  40.21 
 
 
258 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5731  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.836966 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
256 aa  136  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0362  hypothetical protein  34.98 
 
 
257 aa  135  5e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  34.98 
 
 
257 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.95 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.69 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0676  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
254 aa  132  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00917144  normal  0.0792915 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.62 
 
 
242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.14693  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
247 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0179  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
247 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0188  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
247 aa  131  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.212596  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0703  Short-chain alcohol dehydrogenase  37.02 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.465762  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47104  non ribosomal peptide synthase  33.06 
 
 
1367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00421455  normal  0.304991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2888  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
257 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3922  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
250 aa  129  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.23 
 
 
247 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
255 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
272 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4590  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.78 
 
 
242 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1086  Short-chain alcohol dehydrogenase of unknown specificity  35.22 
 
 
247 aa  128  9.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.144372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0471  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.06 
 
 
254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  33.61 
 
 
241 aa  126  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
240 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  normal  0.85584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
280 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.962145  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 
267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0979  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
254 aa  125  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.495407 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3589  hypothetical protein  31.36 
 
 
242 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00166037  normal  0.283325 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
248 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.172179  normal  0.840489 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
231 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
231 aa  125  7e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1696  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.47 
 
 
258 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.817291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
250 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>