More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0770 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
277 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.86 
 
 
268 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
270 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
270 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.24 
 
 
270 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.73 
 
 
288 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.85 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.59 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
286 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.04 
 
 
324 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
324 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.43 
 
 
286 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
287 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
287 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 
287 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
287 aa  168  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
322 aa  167  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
298 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.11 
 
 
327 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.19 
 
 
279 aa  154  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  32.99 
 
 
334 aa  143  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
308 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  29.97 
 
 
304 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.88 
 
 
309 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.28 
 
 
290 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  32.27 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  30.96 
 
 
304 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  29.89 
 
 
304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  30.14 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.73 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  30.14 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  32.9 
 
 
305 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  30.14 
 
 
307 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.81 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 
283 aa  109  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  29.63 
 
 
304 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
287 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.62 
 
 
307 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  31.08 
 
 
303 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  33.04 
 
 
298 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
308 aa  106  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.6 
 
 
293 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  29.33 
 
 
351 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  31.71 
 
 
303 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  30.45 
 
 
303 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  30.66 
 
 
314 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
303 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.52 
 
 
284 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.09 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 
283 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 
280 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.53 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  29.39 
 
 
550 aa  92.4  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
304 aa  92.4  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  28.01 
 
 
315 aa  92  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 
255 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2742  short chain dehydrogenase  35.27 
 
 
252 aa  89  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0442377  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  32.33 
 
 
256 aa  89  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189407 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3825  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
261 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
302 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
261 aa  87  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429944  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.4 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.6 
 
 
244 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.97 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.347308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2571  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.52 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0716578  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  35.11 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.449608  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0620  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  31.31 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.890979 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  32.17 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.33 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.61 
 
 
255 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  32.02 
 
 
254 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
234 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.221746  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  31.28 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.25 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40890  short chain dehydrogenase  29.07 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3468  short chain dehydrogenase  29.07 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1151  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.04 
 
 
234 aa  80.9  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.256582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2074  short chain dehydrogenase  27.75 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0334632  normal  0.0500399 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  31.3 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.56 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
271 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3658  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.57 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  30.87 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01007  short chain dehydrogenase  28.02 
 
 
253 aa  79.3  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.393478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.8 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3215  short chain dehydrogenase  28.02 
 
 
255 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.57556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.6 
 
 
246 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1493  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.71 
 
 
247 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.517658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>