More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1937 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1937  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
308 aa  612  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0246  short chain dehydrogenase  69.93 
 
 
351 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.153805  normal  0.728482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2781  short chain dehydrogenase  70.2 
 
 
307 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2751  short chain dehydrogenase  69.67 
 
 
307 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2795  short chain dehydrogenase  69.67 
 
 
307 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.145594  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1029  short chain dehydrogenase  58.25 
 
 
304 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.98 
 
 
309 aa  342  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.591318  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0897  short chain dehydrogenase  58.78 
 
 
304 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.59 
 
 
308 aa  338  9e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.570438  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0371  short chain dehydrogenase  58.78 
 
 
305 aa  332  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3979  short chain dehydrogenase  59.67 
 
 
304 aa  328  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0555299  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4136  short chain dehydrogenase  57.77 
 
 
304 aa  326  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.210965  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1242  short chain dehydrogenase  59.12 
 
 
308 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0581  short chain dehydrogenase  57.77 
 
 
303 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.952569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0585  short chain dehydrogenase  57.09 
 
 
314 aa  319  3e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0592  short chain dehydrogenase  56.33 
 
 
303 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0551  short chain dehydrogenase  58.45 
 
 
303 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.387697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  57.43 
 
 
550 aa  301  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.42 
 
 
304 aa  301  8.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0115254  normal  0.127014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  50.33 
 
 
304 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3030  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 
305 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303989  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0102  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.51 
 
 
304 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.440904  hitchhiker  0.000946553 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.85 
 
 
303 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.330008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3383  short chain dehydrogenase  52.56 
 
 
298 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.479442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23700  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  47.46 
 
 
315 aa  249  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.256635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
293 aa  249  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.57979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.93 
 
 
307 aa  248  9e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.122306  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.17 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.607685  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.8 
 
 
302 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.126054  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
298 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
283 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
287 aa  155  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.447162  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4290  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
283 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.850912  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2372  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.87 
 
 
290 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.71 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0183767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3727  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.67 
 
 
279 aa  140  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
286 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 
291 aa  138  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.54 
 
 
284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
324 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3074  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.67 
 
 
324 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0229278  normal  0.993733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1508  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
288 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316144  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1549  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.32 
 
 
288 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
287 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4935  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
287 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
287 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422551  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12303  predicted protein  30.26 
 
 
334 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2630  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 
322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.067703  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.11 
 
 
286 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838169  normal  0.0136631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4906  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.82 
 
 
327 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
277 aa  106  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0289  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
270 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0298  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
270 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 
270 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.202021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3919  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 
268 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2393  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.84 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114782  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3438  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.73 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.02 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  0.250737 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.67 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.25 
 
 
254 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
250 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  25.98 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1935  putative short-chain alcohol dehydrogenase  33.04 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000230306  normal  0.160662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.94443  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.11 
 
 
239 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  24.77 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  26.97 
 
 
265 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.49 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3764  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.28 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000212417  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29 
 
 
272 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0705302  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 
339 aa  72.4  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4265  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.82 
 
 
250 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4325  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.82 
 
 
250 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00118279  normal  0.0328571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.2 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0311  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.12 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.373471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.12 
 
 
295 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.33498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  25.79 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.18 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  25.11 
 
 
260 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0940  putative short-chain dehydrogenase  26.64 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5156  short chain dehydrogenase  29.82 
 
 
254 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.215894  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114191  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0997  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.28 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1877  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.82 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.31 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  24.63 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1782  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.72 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.788783  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0144582 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.68 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0224  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  27.15 
 
 
255 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.717009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.9 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0250629  normal  0.870822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.64 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>