More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33330 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 625 aa  1247    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  38.62 
 
 		 633 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  35.92 
 
 		 662 aa  344  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.01 
 
 		 664 aa  339  9.999999999999999e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  41.33 
 
 		 678 aa  324  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  39.41 
 
 		 619 aa  303  7.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.64 
 
 		 639 aa  293  9e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  36.96 
 
 		 659 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  34.96 
 
 		 661 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  39.44 
 
 		 649 aa  286  9e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  37.46 
 
 		 645 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  35.95 
 
 		 636 aa  260  5.0000000000000005e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  32.74 
 
 		 643 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  36.15 
 
 		 599 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  31.94 
 
 		 627 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  30.99 
 
 		 644 aa  231  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.51 
 
 		 643 aa  223  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  41.67 
 
 		 689 aa  216  9e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  37.5 
 
 		 543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  32.84 
 
 		 630 aa  207  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  31.55 
 
 		 689 aa  206  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  40.22 
 
 		 507 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.57 
 
 		 585 aa  200  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  28.55 
 
 		 603 aa  199  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.25 
 
 		 604 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  32.58 
 
 		 580 aa  198  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  30.91 
 
 		 588 aa  197  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.43 
 
 		 593 aa  195  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  29.18 
 
 		 608 aa  192  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.02 
 
 		 586 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.02 
 
 		 586 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.02 
 
 		 586 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.2 
 
 		 606 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  38.34 
 
 		 540 aa  187  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  37.95 
 
 		 826 aa  187  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  30.28 
 
 		 612 aa  178  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  39.13 
 
 		 608 aa  178  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.2 
 
 		 590 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.2 
 
 		 606 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  40.17 
 
 		 563 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  38.3 
 
 		 512 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  26.91 
 
 		 640 aa  137  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  24.91 
 
 		 610 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  35.01 
 
 		 531 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 		 480 aa  127  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  25.48 
 
 		 598 aa  126  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  27.51 
 
 		 630 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  34.71 
 
 		 573 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  25 
 
 		 574 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  27.18 
 
 		 649 aa  123  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  36.96 
 
 		 570 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  28.68 
 
 		 586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  25 
 
 		 645 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  26.97 
 
 		 648 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  33.16 
 
 		 482 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  24.86 
 
 		 647 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1802  penicillin-binding protein 2  26.92 
 
 		 636 aa  120  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2144  penicillin-binding protein 2, putative  26.92 
 
 		 636 aa  120  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  32.28 
 
 		 489 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  25.59 
 
 		 643 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  28.09 
 
 		 647 aa  118  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  26.9 
 
 		 609 aa  118  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  30.87 
 
 		 647 aa  118  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  24.96 
 
 		 636 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.9 
 
 		 476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  26.52 
 
 		 648 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 		 648 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  25.96 
 
 		 640 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  29.1 
 
 		 648 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  25.67 
 
 		 634 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  27.75 
 
 		 603 aa  113  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  26.57 
 
 		 663 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  24.87 
 
 		 639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  23.57 
 
 		 775 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  26.81 
 
 		 619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1162  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.5 
 
 		 585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153827  normal  0.425668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  36.69 
 
 		 590 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  24.36 
 
 		 642 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 		 485 aa  112  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  25.2 
 
 		 646 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  27.74 
 
 		 660 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.61 
 
 		 489 aa  110  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  24.72 
 
 		 636 aa  110  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2826  penicillin-binding protein 3  23.11 
 
 		 655 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110452 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  23.32 
 
 		 646 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.98 
 
 		 490 aa  109  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0050  peptidoglycan glycosyltransferase  26.7 
 
 		 595 aa  108  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  26.79 
 
 		 615 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  28.15 
 
 		 662 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  27.16 
 
 		 695 aa  108  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  28.66 
 
 		 670 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0443  Peptidoglycan glycosyltransferase  23.16 
 
 		 673 aa  108  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  28.06 
 
 		 681 aa  107  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1887  stage V sporulation protein D  27.23 
 
 		 644 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1641  peptidoglycan glycosyltransferase  23.93 
 
 		 661 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000195033  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  30.95 
 
 		 481 aa  107  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  26.84 
 
 		 597 aa  107  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  25.05 
 
 		 615 aa  106  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  27.27 
 
 		 636 aa  107  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>