More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4630 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2080  penicillin-binding protein, transpeptidase  82.96 
 
 
585 aa  897    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.047299  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4630  penicillin-binding protein, transpeptidase  100 
 
 
593 aa  1164    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4955  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.51 
 
 
586 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5336  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.51 
 
 
586 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5043  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.51 
 
 
586 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836546  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3973  penicillin-binding protein transpeptidase  46.29 
 
 
580 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5886  penicillin-binding protein transpeptidase  42.13 
 
 
599 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2030  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.09 
 
 
606 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.609137  normal  0.0382075 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12880  penicillin-binding lipoprotein  35.26 
 
 
603 aa  320  5e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2266  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.75 
 
 
588 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2047  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.26 
 
 
590 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0844454  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2093  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.26 
 
 
606 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.904796  normal  0.984313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4076  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.99 
 
 
604 aa  303  8.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.311746  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1690  penicillin-binding protein transpeptidase  35.08 
 
 
612 aa  265  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0748496  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2121  penicillin-binding protein transpeptidase  33.5 
 
 
608 aa  262  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.337664  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2190  penicillin-binding protein transpeptidase  34.05 
 
 
644 aa  246  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247055  hitchhiker  0.00185337 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3971  penicillin-binding protein transpeptidase  34.79 
 
 
633 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5329  penicillin-binding protein transpeptidase  33.99 
 
 
619 aa  200  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0349  penicillin-binding protein  30.4 
 
 
540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33330  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.3 
 
 
625 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3275  penicillin-binding protein transpeptidase  33.59 
 
 
661 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06090  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  32.19 
 
 
636 aa  187  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3919  penicillin-binding protein transpeptidase  30.94 
 
 
662 aa  180  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4062  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  30.77 
 
 
543 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115206  normal  0.0599617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4600  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.92 
 
 
639 aa  177  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36830  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.09 
 
 
645 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00463694  normal  0.702417 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3460  penicillin-binding protein transpeptidase  32.84 
 
 
659 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1441  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  41.23 
 
 
507 aa  170  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4146  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.16 
 
 
664 aa  170  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1727  penicillin-binding protein transpeptidase  40.13 
 
 
540 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23852  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1089  penicillin-binding protein transpeptidase  40.47 
 
 
608 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1416  putative secreted penicillin binding protein  37.34 
 
 
689 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.451828  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0389  penicillin-binding protein transpeptidase  32.68 
 
 
649 aa  157  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.998965  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7683  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  41.25 
 
 
512 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3641  penicillin-binding protein, transpeptidase  39.94 
 
 
563 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1448  penicillin-binding protein transpeptidase  35.5 
 
 
570 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0475  penicillin-binding protein transpeptidase  33.53 
 
 
678 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00366439  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4485  NTF2 domain protein transpeptidase  28.18 
 
 
559 aa  138  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.338664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3583  Cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2-like protein  41.08 
 
 
531 aa  138  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.227285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1307  penicillin-binding protein transpeptidase  36.22 
 
 
573 aa  137  6.0000000000000005e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3720  penicillin-binding protein transpeptidase  28.41 
 
 
689 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290465  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4002  NTF2 domain protein transpeptidase  27.39 
 
 
643 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2552  penicillin-binding protein transpeptidase  33.8 
 
 
826 aa  130  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.389315  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  28.57 
 
 
471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1456  putative penicillin-binding protein  25.85 
 
 
627 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2475  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  28.46 
 
 
643 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5826  penicillin-binding protein transpeptidase  34.37 
 
 
590 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.739783  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0796  NTF2 domain-containing protein transpeptidase  26.96 
 
 
630 aa  111  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6659  penicillin-binding protein transpeptidase  33.22 
 
 
417 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.41 
 
 
489 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  30.14 
 
 
492 aa  106  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 
478 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 
480 aa  103  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.75 
 
 
458 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  32.2 
 
 
485 aa  101  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  29.19 
 
 
473 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.05 
 
 
493 aa  99.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  25.73 
 
 
649 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.09 
 
 
472 aa  98.6  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  30.09 
 
 
487 aa  98.2  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.29 
 
 
485 aa  97.8  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.09 
 
 
487 aa  97.8  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.21 
 
 
485 aa  97.4  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4602  peptidoglycan glycosyltransferase  29.31 
 
 
660 aa  97.4  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.75 
 
 
547 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  29.3 
 
 
470 aa  96.3  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2090  peptidoglycan glycosyltransferase  29.2 
 
 
597 aa  96.3  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.27584  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3016  peptidoglycan glycosyltransferase  29.2 
 
 
603 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  28.76 
 
 
639 aa  94.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 
504 aa  94.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  25.64 
 
 
972 aa  94.4  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  29.13 
 
 
489 aa  94  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2605  penicillin-binding protein 2  28.54 
 
 
605 aa  94  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  23.67 
 
 
640 aa  93.6  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.08 
 
 
503 aa  92.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  26.61 
 
 
551 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  29.91 
 
 
481 aa  91.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  26.96 
 
 
822 aa  91.7  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  27.55 
 
 
535 aa  91.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 
483 aa  91.7  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 
503 aa  90.9  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 
480 aa  90.5  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  29.77 
 
 
648 aa  90.5  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  29.77 
 
 
648 aa  90.5  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1434  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 
549 aa  90.9  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  24.46 
 
 
646 aa  90.5  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  28.51 
 
 
648 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  35.29 
 
 
501 aa  89.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  29.07 
 
 
646 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.72 
 
 
488 aa  89.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  31.38 
 
 
488 aa  89.4  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.27 
 
 
476 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2250  peptidoglycan glycosyltransferase  28.95 
 
 
606 aa  88.2  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  29.23 
 
 
560 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  24.48 
 
 
647 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  29.33 
 
 
648 aa  86.7  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  25.55 
 
 
609 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
482 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.74 
 
 
954 aa  84.7  0.000000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  34.62 
 
 
489 aa  84.3  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>