More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5929 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 663 aa  1350    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  39.59 
 
 		 808 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2498  peptidoglycan glycosyltransferase  39.31 
 
 		 682 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  39.47 
 
 		 684 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  39.31 
 
 		 684 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  37.89 
 
 		 639 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  36.69 
 
 		 634 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.92 
 
 		 643 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  35.19 
 
 		 647 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 		 642 aa  343  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  34.69 
 
 		 645 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  34.63 
 
 		 646 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  36.72 
 
 		 619 aa  336  9e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 		 636 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  34.86 
 
 		 609 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  31.83 
 
 		 640 aa  318  2e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.44 
 
 		 645 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  34.5 
 
 		 640 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  31.1 
 
 		 610 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  31.29 
 
 		 574 aa  303  9e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  34.06 
 
 		 611 aa  302  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  31.96 
 
 		 641 aa  302  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  31.15 
 
 		 646 aa  301  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 		 755 aa  294  4e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.81 
 
 		 633 aa  294  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  34.92 
 
 		 681 aa  290  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  32.14 
 
 		 801 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.66 
 
 		 671 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.4 
 
 		 636 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  32.12 
 
 		 615 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 		 630 aa  283  5.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  32.9 
 
 		 629 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  33.01 
 
 		 629 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  32.37 
 
 		 646 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 		 634 aa  282  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  32.09 
 
 		 630 aa  281  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  32.73 
 
 		 629 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  34.06 
 
 		 636 aa  280  6e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  33.39 
 
 		 631 aa  280  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  31.67 
 
 		 602 aa  279  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 629 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 		 631 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  30.89 
 
 		 643 aa  277  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 		 618 aa  277  5e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  31.53 
 
 		 646 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  33.39 
 
 		 647 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  32.78 
 
 		 628 aa  275  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  31.64 
 
 		 800 aa  275  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  31.57 
 
 		 801 aa  273  7e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  32.01 
 
 		 643 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  34.89 
 
 		 624 aa  273  8.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 		 766 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  31.19 
 
 		 691 aa  273  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 		 631 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  31.77 
 
 		 647 aa  272  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  31.02 
 
 		 608 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  32.59 
 
 		 648 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  31.63 
 
 		 640 aa  270  5e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  31.26 
 
 		 801 aa  270  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  34.16 
 
 		 662 aa  270  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  29.85 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 		 607 aa  269  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  30.85 
 
 		 802 aa  269  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  33.11 
 
 		 626 aa  269  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  32.44 
 
 		 648 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  29.24 
 
 		 703 aa  268  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  33.66 
 
 		 627 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  30.88 
 
 		 803 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  30.88 
 
 		 803 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  30.88 
 
 		 809 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  29.36 
 
 		 599 aa  266  8e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  30.88 
 
 		 802 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  30.88 
 
 		 802 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  30.88 
 
 		 802 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  30.88 
 
 		 802 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  31.2 
 
 		 631 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  32.59 
 
 		 648 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  31.2 
 
 		 667 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  32.59 
 
 		 648 aa  266  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  31.37 
 
 		 629 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 		 630 aa  265  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  32.4 
 
 		 646 aa  265  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  31.02 
 
 		 637 aa  265  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  31.9 
 
 		 629 aa  264  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  29.8 
 
 		 678 aa  264  4e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  30.22 
 
 		 760 aa  264  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  30.61 
 
 		 588 aa  264  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  30.39 
 
 		 775 aa  264  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.8 
 
 		 673 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  30.46 
 
 		 793 aa  264  4.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 		 765 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 		 765 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  30.22 
 
 		 756 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  31.7 
 
 		 630 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  31.12 
 
 		 597 aa  263  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 		 764 aa  263  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  32.25 
 
 		 632 aa  263  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1347  penicillin-binding protein 2  30.18 
 
 		 601 aa  261  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  31.07 
 
 		 655 aa  261  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  32.87 
 
 		 686 aa  261  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>