More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0104 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
599 aa  1213    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  35.57 
 
 
639 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  36.24 
 
 
586 aa  371  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  35.33 
 
 
643 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  34.16 
 
 
636 aa  346  8e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 
645 aa  346  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 
636 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 
634 aa  345  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 
647 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  33.51 
 
 
586 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  34.8 
 
 
619 aa  340  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 
642 aa  340  5e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  34.67 
 
 
645 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  33.95 
 
 
646 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  35.21 
 
 
629 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  35.04 
 
 
629 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 
631 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  35.04 
 
 
629 aa  330  6e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  34.93 
 
 
646 aa  330  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  34.93 
 
 
629 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  35.64 
 
 
574 aa  327  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  34.93 
 
 
646 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  33.75 
 
 
640 aa  324  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 
630 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  33.77 
 
 
628 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  34.87 
 
 
631 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  34.87 
 
 
631 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  34.71 
 
 
611 aa  319  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 
630 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.99 
 
 
609 aa  318  1e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 
618 aa  318  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  32.28 
 
 
632 aa  316  7e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  32.34 
 
 
630 aa  312  9e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  33.94 
 
 
801 aa  311  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  33.71 
 
 
803 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  33.71 
 
 
809 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  33.71 
 
 
803 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 
802 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 
802 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  33.66 
 
 
802 aa  310  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  32.74 
 
 
632 aa  310  4e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 
802 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 
802 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 
643 aa  310  5e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  32.9 
 
 
800 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  31.35 
 
 
626 aa  309  8e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 
801 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  33.66 
 
 
637 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 
801 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 
761 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 
634 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 
641 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  32.61 
 
 
629 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  32.12 
 
 
681 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  33.72 
 
 
607 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 
605 aa  304  4.0000000000000003e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 
629 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  33.71 
 
 
631 aa  303  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  34.04 
 
 
631 aa  303  6.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  33.88 
 
 
631 aa  303  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 
628 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  31.76 
 
 
602 aa  302  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 
764 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
627 aa  301  2e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  31.84 
 
 
638 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  32.79 
 
 
633 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  32.79 
 
 
633 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  32.84 
 
 
775 aa  301  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  32.79 
 
 
633 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  32.79 
 
 
633 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  32.79 
 
 
633 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.39 
 
 
633 aa  300  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  33.51 
 
 
617 aa  300  5e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  32.53 
 
 
765 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.53 
 
 
765 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  32.53 
 
 
760 aa  300  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  32.95 
 
 
612 aa  300  6e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 
648 aa  300  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
633 aa  299  9e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  33.11 
 
 
615 aa  299  9e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  32.95 
 
 
633 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
633 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
633 aa  299  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  33.51 
 
 
617 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
633 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  32.37 
 
 
681 aa  299  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
633 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  33 
 
 
756 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  32.95 
 
 
633 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
633 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  32.95 
 
 
633 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 
646 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 
618 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 
618 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 
618 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  31.26 
 
 
755 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  31.82 
 
 
596 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 
618 aa  297  3e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
655 aa  297  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  32.79 
 
 
631 aa  297  4e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>