More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1046 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  100 
 
 
619 aa  1269    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  50.93 
 
 
639 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  49.66 
 
 
643 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  49.92 
 
 
642 aa  580  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  47.74 
 
 
636 aa  581  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  46.23 
 
 
647 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  45.48 
 
 
645 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  47.82 
 
 
640 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  41.97 
 
 
634 aa  486  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  41.55 
 
 
646 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  40.52 
 
 
609 aa  445  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  40.62 
 
 
628 aa  440  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  40.1 
 
 
648 aa  428  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  38.09 
 
 
645 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  39.26 
 
 
636 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  38.7 
 
 
602 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  39.66 
 
 
648 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  39.97 
 
 
647 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  39.9 
 
 
648 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  37.54 
 
 
755 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  39.9 
 
 
648 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  40.92 
 
 
647 aa  415  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  39.19 
 
 
629 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  39.67 
 
 
624 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  38.86 
 
 
626 aa  411  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  39.02 
 
 
629 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  39.02 
 
 
631 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  39.19 
 
 
629 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  38.85 
 
 
629 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  39.31 
 
 
646 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  39.78 
 
 
681 aa  405  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  38.04 
 
 
630 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  39.19 
 
 
631 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  38.5 
 
 
600 aa  399  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  38.34 
 
 
646 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.03 
 
 
618 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  37.72 
 
 
611 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  36.43 
 
 
597 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  38.85 
 
 
631 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  38.06 
 
 
689 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  36.85 
 
 
643 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  38.05 
 
 
630 aa  391  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  37.84 
 
 
646 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  38.64 
 
 
649 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  38.95 
 
 
633 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  38.04 
 
 
630 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  36.71 
 
 
637 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  36.92 
 
 
808 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  36.67 
 
 
662 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  35.65 
 
 
760 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  35.98 
 
 
640 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  35.94 
 
 
655 aa  382  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  36.55 
 
 
630 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 
607 aa  382  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  35.65 
 
 
765 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  35.65 
 
 
765 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  37.87 
 
 
595 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  36.06 
 
 
809 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  36.06 
 
 
803 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  35.7 
 
 
640 aa  379  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2498  peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 
682 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  36.56 
 
 
619 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  39.14 
 
 
639 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  35.82 
 
 
574 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  38.37 
 
 
670 aa  379  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  35.45 
 
 
800 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  35.43 
 
 
684 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 
764 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  37.09 
 
 
630 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  35.6 
 
 
684 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  37.33 
 
 
615 aa  375  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  35.49 
 
 
756 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  35.91 
 
 
803 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  36.12 
 
 
802 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  35.82 
 
 
761 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  36.12 
 
 
802 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  37.17 
 
 
612 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  36.44 
 
 
610 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 
691 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  36.12 
 
 
802 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  36.12 
 
 
802 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  36.32 
 
 
631 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  35.46 
 
 
775 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  35.06 
 
 
801 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  37 
 
 
681 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  36.36 
 
 
655 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  35.92 
 
 
802 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  35.62 
 
 
673 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.07 
 
 
671 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  36.32 
 
 
667 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  35.41 
 
 
703 aa  369  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  36.18 
 
 
618 aa  366  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  34.22 
 
 
623 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  34.22 
 
 
623 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 
618 aa  366  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  37.02 
 
 
634 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  35.71 
 
 
602 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  35.71 
 
 
602 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.87 
 
 
640 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  34.51 
 
 
599 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>