More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4035 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  57.5 
 
 		 647 aa  778    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  60.96 
 
 		 648 aa  817    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  60.96 
 
 		 648 aa  817    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  60.96 
 
 		 648 aa  826    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  54.04 
 
 		 649 aa  694    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  59.41 
 
 		 648 aa  778    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 647 aa  1311    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  46.27 
 
 		 628 aa  545  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  46.15 
 
 		 681 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  47.17 
 
 		 624 aa  528  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  43.65 
 
 		 634 aa  490  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  44.06 
 
 		 662 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  41.92 
 
 		 689 aa  471  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  42.13 
 
 		 639 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  43.36 
 
 		 636 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  41.63 
 
 		 658 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  41.07 
 
 		 670 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  41.2 
 
 		 609 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0497  peptidoglycan glycosyltransferase  39.46 
 
 		 634 aa  409  1e-113  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  38.22 
 
 		 629 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  41.75 
 
 		 619 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  38.06 
 
 		 629 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  38.06 
 
 		 629 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  37.34 
 
 		 630 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  38.22 
 
 		 629 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  39.41 
 
 		 631 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  39.41 
 
 		 631 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  37.73 
 
 		 631 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  37.07 
 
 		 646 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  37.04 
 
 		 643 aa  369  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.8 
 
 		 640 aa  369  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.83 
 
 		 633 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  35.59 
 
 		 627 aa  365  1e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  34.84 
 
 		 610 aa  365  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  36.45 
 
 		 619 aa  364  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  37.97 
 
 		 626 aa  365  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  36.47 
 
 		 646 aa  364  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  35.52 
 
 		 618 aa  363  4e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  36.36 
 
 		 639 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  37.63 
 
 		 640 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  37.12 
 
 		 632 aa  361  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  34.21 
 
 		 618 aa  360  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  35.5 
 
 		 634 aa  360  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  36.67 
 
 		 627 aa  360  4e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  34.59 
 
 		 618 aa  359  7e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  34.22 
 
 		 628 aa  359  9.999999999999999e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 		 618 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 		 618 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 		 618 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  37.91 
 
 		 664 aa  357  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  36.38 
 
 		 611 aa  357  5e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  35.28 
 
 		 629 aa  357  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  37.66 
 
 		 662 aa  356  5.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  34.75 
 
 		 618 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 		 618 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 		 618 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  34.26 
 
 		 618 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 		 618 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  34.68 
 
 		 638 aa  354  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  35.13 
 
 		 629 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.44 
 
 		 642 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 		 618 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 		 643 aa  352  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.37 
 
 		 618 aa  351  3e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  34 
 
 		 610 aa  350  4e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  32.74 
 
 		 637 aa  350  6e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.06 
 
 		 636 aa  350  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  33.82 
 
 		 631 aa  348  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  34.74 
 
 		 636 aa  347  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  36.82 
 
 		 630 aa  347  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  34.95 
 
 		 645 aa  347  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  34.77 
 
 		 631 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  34.77 
 
 		 631 aa  347  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  34.77 
 
 		 631 aa  346  7e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  35.49 
 
 		 630 aa  346  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  34.19 
 
 		 637 aa  344  2e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  34.94 
 
 		 647 aa  345  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  36.2 
 
 		 630 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  32.63 
 
 		 607 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  37.37 
 
 		 646 aa  343  5.999999999999999e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.52 
 
 		 641 aa  343  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  34.7 
 
 		 678 aa  343  7e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  36.14 
 
 		 667 aa  343  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  34.44 
 
 		 618 aa  342  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  36.14 
 
 		 631 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  33.17 
 
 		 632 aa  341  2.9999999999999998e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  33.66 
 
 		 634 aa  340  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  36.07 
 
 		 655 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  35.09 
 
 		 626 aa  339  7e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 		 636 aa  339  8e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  33.82 
 
 		 633 aa  337  5e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 		 634 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  34.06 
 
 		 602 aa  335  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  34.06 
 
 		 602 aa  335  2e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 		 633 aa  334  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 		 633 aa  334  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 		 633 aa  334  3e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  33.17 
 
 		 633 aa  334  3e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 		 633 aa  334  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  33.17 
 
 		 633 aa  334  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>