More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0143 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  91.29 
 
 		 760 aa  1254    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  56.27 
 
 		 646 aa  669    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  68.45 
 
 		 801 aa  926    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  89.94 
 
 		 802 aa  1370    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  56.15 
 
 		 636 aa  734    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  67.81 
 
 		 766 aa  923    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  89.94 
 
 		 803 aa  1374    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  92.33 
 
 		 775 aa  1264    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  92.48 
 
 		 761 aa  1266    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  68.6 
 
 		 801 aa  926    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  68.45 
 
 		 801 aa  924    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  72.19 
 
 		 771 aa  1097    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  57.75 
 
 		 635 aa  756    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  89.94 
 
 		 803 aa  1373    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  56.24 
 
 		 646 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  89.94 
 
 		 802 aa  1370    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 802 aa  1631    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  56.42 
 
 		 703 aa  736    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  57.34 
 
 		 673 aa  761    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  81.64 
 
 		 800 aa  1150    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  52.57 
 
 		 645 aa  678    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  55.65 
 
 		 691 aa  721    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  80.29 
 
 		 767 aa  1121    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  69.05 
 
 		 793 aa  932    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  91.45 
 
 		 756 aa  1255    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  54.8 
 
 		 655 aa  679    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  91.41 
 
 		 765 aa  1253    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  89.94 
 
 		 802 aa  1370    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0357  penicillin-binding protein 2  52.24 
 
 		 681 aa  677    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  91.59 
 
 		 764 aa  1258    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  91.41 
 
 		 765 aa  1253    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  57.12 
 
 		 635 aa  746    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  53.73 
 
 		 679 aa  717    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  89.4 
 
 		 809 aa  1371    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  58.16 
 
 		 681 aa  720    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  57.19 
 
 		 648 aa  716    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  55.73 
 
 		 683 aa  722    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  56.12 
 
 		 646 aa  666    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  89.94 
 
 		 802 aa  1370    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  56.49 
 
 		 650 aa  726    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  47.95 
 
 		 630 aa  542  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  43.4 
 
 		 629 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  43.85 
 
 		 629 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  43.67 
 
 		 629 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  43.67 
 
 		 629 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  43.16 
 
 		 631 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  44.22 
 
 		 646 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  44.6 
 
 		 631 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  44.6 
 
 		 631 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  43.06 
 
 		 630 aa  500  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  44.48 
 
 		 646 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  45.65 
 
 		 611 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.94 
 
 		 618 aa  489  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  42.03 
 
 		 630 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  41.2 
 
 		 638 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  41.49 
 
 		 629 aa  481  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  42.25 
 
 		 630 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  41.8 
 
 		 631 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  40.82 
 
 		 638 aa  477  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  42.06 
 
 		 629 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  42.27 
 
 		 633 aa  478  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  41.8 
 
 		 667 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  41.16 
 
 		 655 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  40.8 
 
 		 633 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  40.09 
 
 		 641 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  40.8 
 
 		 633 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  40.8 
 
 		 633 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  40.8 
 
 		 633 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  40.8 
 
 		 633 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  40.25 
 
 		 633 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  40.25 
 
 		 633 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  40.25 
 
 		 633 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  40.82 
 
 		 631 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  40.25 
 
 		 633 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  40.25 
 
 		 633 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  40.76 
 
 		 633 aa  471  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  40.25 
 
 		 633 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  40.25 
 
 		 633 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  40.25 
 
 		 633 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  39.62 
 
 		 634 aa  466  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  40.76 
 
 		 618 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  40.09 
 
 		 633 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  40.88 
 
 		 618 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  40.51 
 
 		 610 aa  465  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  39.1 
 
 		 631 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  38.94 
 
 		 631 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  39.1 
 
 		 631 aa  465  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  39.35 
 
 		 634 aa  463  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  40.28 
 
 		 632 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  40.46 
 
 		 678 aa  460  9.999999999999999e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  39.04 
 
 		 634 aa  460  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  41.48 
 
 		 618 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  40.38 
 
 		 627 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  40.28 
 
 		 652 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  41.17 
 
 		 618 aa  458  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  39.22 
 
 		 637 aa  457  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  41.96 
 
 		 662 aa  457  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  41.32 
 
 		 618 aa  459  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  41.32 
 
 		 618 aa  459  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  41.97 
 
 		 630 aa  457  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>