More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1492 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  77.83 
 
 
658 aa  1001    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  100 
 
 
670 aa  1359    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  46.6 
 
 
624 aa  538  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  46.94 
 
 
628 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  44.26 
 
 
647 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  43.75 
 
 
648 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  44.61 
 
 
662 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  42.36 
 
 
681 aa  459  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4035  peptidoglycan glycosyltransferase  41.23 
 
 
647 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.47005 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2131  peptidoglycan glycosyltransferase  43.33 
 
 
689 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  44.57 
 
 
636 aa  452  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  42.17 
 
 
648 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0580  penicillin-binding protein 2  40.74 
 
 
634 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.39479  hitchhiker  0.00000000000028844 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  41.95 
 
 
648 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  41.95 
 
 
648 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  40.45 
 
 
649 aa  434  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0658  peptidoglycan glycosyltransferase  38.56 
 
 
639 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0497  peptidoglycan glycosyltransferase  39.09 
 
 
634 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  38.72 
 
 
609 aa  386  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  39.18 
 
 
611 aa  373  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  36.36 
 
 
643 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  37.33 
 
 
619 aa  369  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  36.76 
 
 
636 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 
646 aa  357  2.9999999999999997e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  38.79 
 
 
640 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  36.15 
 
 
631 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  38.29 
 
 
630 aa  355  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  35.55 
 
 
610 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  35.87 
 
 
639 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  37.01 
 
 
646 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  36.59 
 
 
647 aa  353  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 
618 aa  350  7e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  36.73 
 
 
619 aa  349  8e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  36.73 
 
 
646 aa  349  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  35.55 
 
 
645 aa  349  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  36.04 
 
 
629 aa  349  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  35.24 
 
 
627 aa  348  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  35.02 
 
 
618 aa  347  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 
703 aa  347  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  37.6 
 
 
645 aa  347  6e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  34.81 
 
 
618 aa  346  8e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  34.81 
 
 
618 aa  346  8e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  36.92 
 
 
679 aa  344  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  34.81 
 
 
618 aa  345  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 
642 aa  345  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  34.81 
 
 
618 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  36.1 
 
 
673 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  35.57 
 
 
629 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  36.56 
 
 
631 aa  343  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  35.47 
 
 
636 aa  343  5e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  37.19 
 
 
630 aa  343  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  36.82 
 
 
633 aa  343  5.999999999999999e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  35.57 
 
 
629 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 
618 aa  343  8e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 
618 aa  343  8e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  34.04 
 
 
618 aa  343  8e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  34.04 
 
 
618 aa  343  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 
640 aa  342  1e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  36.22 
 
 
631 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  35.13 
 
 
629 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  37.36 
 
 
801 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  34.68 
 
 
602 aa  340  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  34.68 
 
 
602 aa  340  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  37.03 
 
 
630 aa  340  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.44 
 
 
618 aa  339  8e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  37.35 
 
 
630 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  36 
 
 
766 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  36.08 
 
 
627 aa  337  5e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 
618 aa  336  7e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  36.45 
 
 
650 aa  336  7e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.77 
 
 
640 aa  336  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  33.12 
 
 
634 aa  335  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  34.79 
 
 
632 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  32.9 
 
 
610 aa  335  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 
667 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  33.71 
 
 
618 aa  333  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  32.79 
 
 
628 aa  333  6e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  34.49 
 
 
755 aa  333  8e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 
607 aa  333  9e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  35.71 
 
 
631 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  34.98 
 
 
641 aa  332  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  35.9 
 
 
793 aa  332  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  34.35 
 
 
638 aa  332  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  35.61 
 
 
630 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  35.55 
 
 
629 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  34.25 
 
 
623 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 
618 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  34.25 
 
 
623 aa  330  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  37.26 
 
 
646 aa  330  7e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  34.25 
 
 
623 aa  329  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  34.25 
 
 
623 aa  329  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  35.48 
 
 
615 aa  329  9e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  37.26 
 
 
646 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  35.15 
 
 
602 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  36.11 
 
 
634 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  34.09 
 
 
623 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  35.48 
 
 
612 aa  328  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  36.83 
 
 
691 aa  327  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  35.61 
 
 
655 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  36.23 
 
 
802 aa  327  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>