More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_14210 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
671 aa  1353    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  34.41 
 
 
634 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.77 
 
 
636 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 
643 aa  372  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  36.53 
 
 
574 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  33.92 
 
 
645 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  34.25 
 
 
639 aa  361  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 
647 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  35.95 
 
 
619 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33.85 
 
 
645 aa  352  1e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  35.05 
 
 
646 aa  342  1e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  34.91 
 
 
596 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 
646 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  36.05 
 
 
625 aa  332  9e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  33.17 
 
 
609 aa  332  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.38 
 
 
642 aa  329  8e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  32.07 
 
 
661 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  33.83 
 
 
640 aa  328  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3931  penicillin-binding protein 2  34.67 
 
 
600 aa  324  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  32.22 
 
 
640 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  31.46 
 
 
669 aa  318  1e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  32.38 
 
 
637 aa  317  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  34.71 
 
 
709 aa  316  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  31.78 
 
 
678 aa  316  8e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  31.34 
 
 
629 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  31.34 
 
 
629 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  34.56 
 
 
644 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  32.27 
 
 
703 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  31.43 
 
 
629 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  33.01 
 
 
617 aa  314  3.9999999999999997e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  31.26 
 
 
643 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  31.31 
 
 
629 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 
662 aa  312  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  34.44 
 
 
600 aa  311  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  32.9 
 
 
613 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.49 
 
 
618 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  32.36 
 
 
630 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  35.29 
 
 
701 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.23 
 
 
658 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.68 
 
 
631 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 
627 aa  310  8e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 
664 aa  309  9e-83  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  34.8 
 
 
605 aa  309  9e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 
630 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  35.09 
 
 
775 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  31.38 
 
 
626 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  32.5 
 
 
637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  33.07 
 
 
619 aa  306  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  32.64 
 
 
646 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  31.63 
 
 
602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  31.63 
 
 
602 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 
632 aa  305  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  33.5 
 
 
588 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.81 
 
 
633 aa  303  9e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  32.26 
 
 
633 aa  302  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.83 
 
 
631 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  32.9 
 
 
646 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  31.94 
 
 
633 aa  301  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  29.73 
 
 
628 aa  301  3e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  30.1 
 
 
716 aa  300  4e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  31.94 
 
 
633 aa  300  5e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  31.94 
 
 
633 aa  300  5e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  31.94 
 
 
633 aa  300  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  31.94 
 
 
633 aa  300  5e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  31.94 
 
 
633 aa  300  5e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  31.94 
 
 
633 aa  300  5e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  31.94 
 
 
633 aa  300  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  31.94 
 
 
633 aa  300  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3451  penicillin-binding protein 2  34.84 
 
 
691 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  33.07 
 
 
607 aa  299  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.74 
 
 
630 aa  299  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.66 
 
 
631 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  32.58 
 
 
631 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  32.63 
 
 
634 aa  298  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  32.52 
 
 
610 aa  297  4e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  33.91 
 
 
586 aa  297  5e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  32.58 
 
 
634 aa  297  5e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  32.49 
 
 
599 aa  296  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  31.09 
 
 
667 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 
633 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 
633 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 
633 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  32.28 
 
 
634 aa  294  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 
633 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 
633 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 
636 aa  294  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  33.12 
 
 
686 aa  294  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  32.25 
 
 
631 aa  293  5e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  31.46 
 
 
641 aa  293  6e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  32.09 
 
 
631 aa  293  9e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  30.65 
 
 
630 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  31.19 
 
 
629 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  32.01 
 
 
611 aa  291  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  32.15 
 
 
681 aa  291  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  31.93 
 
 
631 aa  290  5.0000000000000004e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 
612 aa  290  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  29.69 
 
 
638 aa  290  8e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 
612 aa  290  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  30.74 
 
 
638 aa  289  1e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  32.52 
 
 
646 aa  289  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>