More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1638 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 703 aa  1449    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  45.63 
 
 		 689 aa  540  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  40.27 
 
 		 661 aa  482  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  39.79 
 
 		 655 aa  465  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  41.68 
 
 		 658 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  37.64 
 
 		 697 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  38.48 
 
 		 646 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 		 643 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  33.53 
 
 		 645 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  33.54 
 
 		 647 aa  340  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  32.59 
 
 		 639 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  32.89 
 
 		 636 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.19 
 
 		 642 aa  337  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  37.02 
 
 		 761 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  34.13 
 
 		 625 aa  326  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.27 
 
 		 671 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  33.28 
 
 		 709 aa  313  5.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  33.64 
 
 		 640 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  32.67 
 
 		 636 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  31.63 
 
 		 619 aa  299  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  33.62 
 
 		 701 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  31.55 
 
 		 801 aa  293  6e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  31.71 
 
 		 681 aa  287  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  30.75 
 
 		 766 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  30.8 
 
 		 679 aa  280  9e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  30.24 
 
 		 800 aa  277  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  31.22 
 
 		 801 aa  275  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  30.97 
 
 		 673 aa  275  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  31.37 
 
 		 801 aa  274  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  29.15 
 
 		 700 aa  273  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  30.43 
 
 		 809 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  30.43 
 
 		 803 aa  271  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  29.94 
 
 		 646 aa  271  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  30.74 
 
 		 793 aa  270  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  29.81 
 
 		 703 aa  268  2e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  30.43 
 
 		 802 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  30.29 
 
 		 803 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  30.29 
 
 		 802 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  30.29 
 
 		 802 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  30.29 
 
 		 802 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  30.29 
 
 		 802 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  29.97 
 
 		 767 aa  266  8e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  30.16 
 
 		 771 aa  264  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  29.46 
 
 		 670 aa  263  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  30.71 
 
 		 618 aa  258  4e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 		 618 aa  258  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 		 618 aa  258  4e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 		 618 aa  258  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  27.48 
 
 		 716 aa  257  6e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  30.13 
 
 		 600 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 		 618 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.21 
 
 		 618 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  29.45 
 
 		 629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  27.96 
 
 		 644 aa  254  3e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  28.96 
 
 		 635 aa  254  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  30.53 
 
 		 683 aa  254  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  30.25 
 
 		 618 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  30.06 
 
 		 618 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  30.17 
 
 		 655 aa  254  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  30.44 
 
 		 627 aa  253  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  29.3 
 
 		 629 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  29.77 
 
 		 618 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  29.8 
 
 		 631 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  29.46 
 
 		 684 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  28.49 
 
 		 686 aa  251  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  29.17 
 
 		 663 aa  251  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 650 aa  250  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  29.32 
 
 		 684 aa  250  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  29.71 
 
 		 662 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.01 
 
 		 629 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  29.01 
 
 		 629 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2498  peptidoglycan glycosyltransferase  29.34 
 
 		 682 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  29.57 
 
 		 636 aa  248  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  28.97 
 
 		 648 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  28.72 
 
 		 635 aa  246  9e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  29.06 
 
 		 648 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  28.64 
 
 		 574 aa  246  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 		 691 aa  246  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  29.06 
 
 		 648 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  30.19 
 
 		 613 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  29.3 
 
 		 640 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.8 
 
 		 609 aa  245  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 		 646 aa  244  3.9999999999999997e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  29.55 
 
 		 588 aa  244  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 		 633 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  27.69 
 
 		 602 aa  243  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 		 633 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 		 633 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 		 633 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  29.6 
 
 		 633 aa  243  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  27.98 
 
 		 708 aa  243  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  29.2 
 
 		 648 aa  243  1e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  29.32 
 
 		 640 aa  242  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  29.22 
 
 		 633 aa  241  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  29.22 
 
 		 633 aa  241  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  29.89 
 
 		 631 aa  241  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  29.22 
 
 		 633 aa  241  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  29.22 
 
 		 633 aa  241  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  29.22 
 
 		 633 aa  241  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  29.22 
 
 		 633 aa  241  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>