More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1685 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  48.63 
 
 		 716 aa  670    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 670 aa  1337    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  62.54 
 
 		 697 aa  828    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  55.05 
 
 		 686 aa  706    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7279  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.86 
 
 		 692 aa  694    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  48.2 
 
 		 729 aa  580  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  48.41 
 
 		 764 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  45.58 
 
 		 724 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  44.3 
 
 		 708 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0751  peptidoglycan glycosyltransferase  40.87 
 
 		 772 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.810278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09230  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.64 
 
 		 760 aa  456  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.922372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  38.37 
 
 		 646 aa  365  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  33.53 
 
 		 661 aa  340  7e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  35.66 
 
 		 644 aa  337  5e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1260  penicillin-binding protein 2  34.82 
 
 		 724 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.022216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  33.18 
 
 		 658 aa  332  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 		 655 aa  320  6e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  35.2 
 
 		 667 aa  320  7e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 		 643 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.13 
 
 		 639 aa  302  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14210  penicillin-binding protein 2  31.69 
 
 		 709 aa  301  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  31.52 
 
 		 716 aa  300  5e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.57 
 
 		 636 aa  299  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 		 687 aa  295  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.26 
 
 		 642 aa  295  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  30.66 
 
 		 645 aa  294  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.04 
 
 		 647 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  32.97 
 
 		 619 aa  291  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.64 
 
 		 671 aa  280  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 		 636 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 		 703 aa  278  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  31.17 
 
 		 669 aa  278  3e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4348  penicillin-binding protein 2  29.76 
 
 		 697 aa  276  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  30 
 
 		 703 aa  272  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  27.41 
 
 		 574 aa  265  3e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  30.28 
 
 		 628 aa  265  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  28.59 
 
 		 635 aa  264  4e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  30.46 
 
 		 640 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  28.74 
 
 		 635 aa  263  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  29.1 
 
 		 640 aa  261  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  31.43 
 
 		 681 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1630  peptidoglycan glycosyltransferase  29.88 
 
 		 636 aa  260  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0924694  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  31.16 
 
 		 663 aa  259  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  31.95 
 
 		 689 aa  258  2e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  29.32 
 
 		 801 aa  257  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 		 630 aa  257  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 		 645 aa  257  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  28.79 
 
 		 679 aa  256  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 		 632 aa  251  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  27.89 
 
 		 801 aa  250  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.69 
 
 		 633 aa  250  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  29.69 
 
 		 602 aa  250  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  30.29 
 
 		 630 aa  249  1e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  28.59 
 
 		 793 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  30.6 
 
 		 600 aa  249  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.82 
 
 		 611 aa  248  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 		 766 aa  249  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  30.2 
 
 		 634 aa  248  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 		 755 aa  248  3e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  29.83 
 
 		 709 aa  248  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  29.49 
 
 		 650 aa  248  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 		 619 aa  247  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  27.74 
 
 		 801 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  29.54 
 
 		 646 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  28.17 
 
 		 557 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  31.75 
 
 		 761 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  31.25 
 
 		 647 aa  244  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  30.96 
 
 		 586 aa  244  3e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 		 646 aa  244  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  28.96 
 
 		 767 aa  244  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  29.56 
 
 		 629 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  29.49 
 
 		 629 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  28.72 
 
 		 678 aa  242  2e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  30.62 
 
 		 626 aa  242  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  27.37 
 
 		 673 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  29.4 
 
 		 629 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  29.88 
 
 		 617 aa  241  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  27.95 
 
 		 588 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  27.87 
 
 		 617 aa  240  5e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  28.67 
 
 		 771 aa  240  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  29.66 
 
 		 617 aa  239  8e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  26.69 
 
 		 608 aa  239  8e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  28.61 
 
 		 800 aa  239  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 		 624 aa  239  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  28.99 
 
 		 610 aa  239  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4064  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.19 
 
 		 765 aa  239  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  29.32 
 
 		 662 aa  238  2e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  28.35 
 
 		 640 aa  238  3e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  29.46 
 
 		 629 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  29.95 
 
 		 775 aa  237  6e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  29.16 
 
 		 648 aa  237  6e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  28.98 
 
 		 664 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  28.48 
 
 		 631 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  29.92 
 
 		 646 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  30.78 
 
 		 596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  28.59 
 
 		 802 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  28.59 
 
 		 802 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  27.22 
 
 		 646 aa  234  3e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00431  putative penicillin-binding protein  30.59 
 
 		 602 aa  234  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.689764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  28.59 
 
 		 802 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>