More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4064 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4064  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
765 aa  1558    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  36.44 
 
 
586 aa  251  3e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  35.8 
 
 
611 aa  246  9e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 
609 aa  244  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 
645 aa  240  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  34.76 
 
 
557 aa  239  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  31.43 
 
 
597 aa  239  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 
628 aa  238  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.86 
 
 
647 aa  238  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
701 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  34.23 
 
 
557 aa  236  9e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  26.6 
 
 
709 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  32.73 
 
 
645 aa  233  8.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  32.52 
 
 
640 aa  233  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  32.39 
 
 
602 aa  233  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  32.21 
 
 
643 aa  231  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  31.54 
 
 
755 aa  231  6e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  33.59 
 
 
681 aa  230  9e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.93 
 
 
642 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.2 
 
 
643 aa  226  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.03 
 
 
639 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.65 
 
 
671 aa  226  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.3 
 
 
574 aa  224  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  32.82 
 
 
663 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00471  putative penicillin-binding protein  29.77 
 
 
548 aa  224  4.9999999999999996e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  30.31 
 
 
637 aa  224  4.9999999999999996e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  31.43 
 
 
646 aa  224  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  32.75 
 
 
670 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  31.49 
 
 
634 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.87 
 
 
631 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  30.53 
 
 
640 aa  222  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  30.02 
 
 
679 aa  221  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 
691 aa  220  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1085  penicillin-binding protein 2  27.94 
 
 
625 aa  220  7.999999999999999e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  31.75 
 
 
629 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.15 
 
 
636 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  31.75 
 
 
629 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  31.36 
 
 
610 aa  219  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 
610 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  32.67 
 
 
626 aa  218  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0890  peptidoglycan glycosyltransferase  32.65 
 
 
547 aa  218  5e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  32.25 
 
 
633 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1763  penicillin-binding protein 2  32.74 
 
 
658 aa  217  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.549162  normal  0.579943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  31.62 
 
 
629 aa  217  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  31.62 
 
 
631 aa  216  9e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 
630 aa  216  9e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  33.2 
 
 
630 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  31.91 
 
 
670 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  31.43 
 
 
629 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  31.18 
 
 
602 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  31.18 
 
 
602 aa  216  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  31.91 
 
 
646 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  30.68 
 
 
632 aa  214  4.9999999999999996e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0047  peptidoglycan glycosyltransferase  32.6 
 
 
615 aa  214  5.999999999999999e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  32.16 
 
 
615 aa  214  7e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1378  penicillin-binding protein 2  30.94 
 
 
598 aa  213  1e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  32.61 
 
 
681 aa  212  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  34 
 
 
618 aa  212  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  29.5 
 
 
629 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  30.14 
 
 
802 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  31.24 
 
 
631 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  31.59 
 
 
619 aa  212  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  30.08 
 
 
803 aa  212  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  30.49 
 
 
802 aa  212  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  30.55 
 
 
588 aa  212  2e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  30.14 
 
 
802 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  30.14 
 
 
802 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  30.14 
 
 
802 aa  212  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  30.08 
 
 
803 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  30.93 
 
 
646 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  30.67 
 
 
646 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  30.56 
 
 
697 aa  211  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00431  putative penicillin-binding protein  30.42 
 
 
602 aa  211  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.689764  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  28.63 
 
 
673 aa  211  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  30.08 
 
 
809 aa  211  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  31.02 
 
 
640 aa  211  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  31.78 
 
 
662 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 
618 aa  210  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 
618 aa  210  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  29.42 
 
 
599 aa  210  8e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  30.42 
 
 
618 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  28.93 
 
 
636 aa  209  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  31.25 
 
 
627 aa  209  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  30.28 
 
 
627 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 
629 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  31.48 
 
 
655 aa  208  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  30.22 
 
 
618 aa  207  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7279  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.43 
 
 
692 aa  207  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 
630 aa  207  8e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.53 
 
 
658 aa  206  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  31.91 
 
 
646 aa  206  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1373  putative penicillin-binding protein  30.99 
 
 
609 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.741954  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  28.54 
 
 
607 aa  206  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0041  putative penicillin-binding protein  29.47 
 
 
596 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.381944  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00541  putative penicillin-binding protein  30.78 
 
 
609 aa  206  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  33.4 
 
 
630 aa  206  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1175  peptidoglycan glycosyltransferase  28.6 
 
 
533 aa  205  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00491  putative penicillin-binding protein  32.33 
 
 
600 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  31.45 
 
 
686 aa  206  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  28.76 
 
 
635 aa  205  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>