More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1214 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  79.57 
 
 		 764 aa  1126    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 729 aa  1466    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  49.07 
 
 		 697 aa  628  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  46.82 
 
 		 686 aa  587  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  48.31 
 
 		 670 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  44.33 
 
 		 716 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7282  penicillin-binding protein 2  45.52 
 
 		 724 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7279  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.47 
 
 		 692 aa  555  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3462  peptidoglycan glycosyltransferase  40.23 
 
 		 708 aa  480  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.031761  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0751  peptidoglycan glycosyltransferase  37.48 
 
 		 772 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.810278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09230  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.72 
 
 		 760 aa  420  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.922372 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  34.63 
 
 		 644 aa  318  2e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  35.39 
 
 		 646 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1260  penicillin-binding protein 2  33.43 
 
 		 724 aa  308  3e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.022216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  33.92 
 
 		 655 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 		 661 aa  297  5e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  33.04 
 
 		 667 aa  291  4e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 		 671 aa  283  9e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  30.72 
 
 		 716 aa  278  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.12 
 
 		 642 aa  273  7e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  32.33 
 
 		 596 aa  271  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14210  penicillin-binding protein 2  31.26 
 
 		 709 aa  271  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 		 636 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.75 
 
 		 646 aa  259  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  29.18 
 
 		 658 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  31.29 
 
 		 669 aa  253  7e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  28.29 
 
 		 610 aa  253  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  28.59 
 
 		 640 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  28.4 
 
 		 645 aa  251  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  28.61 
 
 		 639 aa  250  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  28.32 
 
 		 647 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  29.38 
 
 		 643 aa  248  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  29.66 
 
 		 619 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  30.66 
 
 		 640 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1638  peptidoglycan glycosyltransferase  28.35 
 
 		 703 aa  243  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0646938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 		 636 aa  242  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  29.88 
 
 		 634 aa  242  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  31.07 
 
 		 687 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2896  penicillin-binding protein 2  28.16 
 
 		 613 aa  237  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  27.91 
 
 		 755 aa  237  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  31.96 
 
 		 628 aa  236  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  30.62 
 
 		 609 aa  234  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  27.52 
 
 		 703 aa  234  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0568  penicillin-binding protein 2  29.38 
 
 		 612 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.116785  normal  0.658129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0551  penicillin-binding protein 2  29.38 
 
 		 612 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  26.56 
 
 		 574 aa  231  3e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2498  peptidoglycan glycosyltransferase  30.08 
 
 		 682 aa  231  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  29.66 
 
 		 681 aa  230  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  29.01 
 
 		 683 aa  230  6e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2131  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.62 
 
 		 761 aa  230  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0043802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  30.08 
 
 		 624 aa  229  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  30.35 
 
 		 775 aa  229  2e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  29.07 
 
 		 617 aa  228  3e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  27.36 
 
 		 643 aa  228  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1454  penicillin-binding protein 2  29.34 
 
 		 684 aa  227  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  29.9 
 
 		 625 aa  227  6e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  28.82 
 
 		 646 aa  227  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  29.38 
 
 		 641 aa  227  6e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  28.57 
 
 		 803 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  29.89 
 
 		 701 aa  226  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1357  penicillin-binding protein 2  29.19 
 
 		 684 aa  226  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.723027  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  28.32 
 
 		 802 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  28.32 
 
 		 802 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  28.32 
 
 		 802 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  28.32 
 
 		 802 aa  225  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00431  putative penicillin-binding protein  29.68 
 
 		 602 aa  225  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.689764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0580  peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 		 605 aa  224  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0863238  normal  0.0511746 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  28.43 
 
 		 809 aa  224  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  28.43 
 
 		 803 aa  224  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  29.24 
 
 		 662 aa  224  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  27.79 
 
 		 640 aa  223  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  28.07 
 
 		 800 aa  223  9e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2430  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.77 
 
 		 695 aa  222  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1373  putative penicillin-binding protein  28.92 
 
 		 609 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.741954  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  28.3 
 
 		 650 aa  222  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  28.33 
 
 		 647 aa  221  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  27.11 
 
 		 679 aa  221  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2304  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 610 aa  221  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5929  penicillin-binding protein 2  28.98 
 
 		 663 aa  221  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  27.84 
 
 		 802 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0540  peptidoglycan glycosyltransferase  29.46 
 
 		 689 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.725377 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  27.08 
 
 		 673 aa  219  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  27.42 
 
 		 767 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  29.08 
 
 		 691 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  27.79 
 
 		 793 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  29.02 
 
 		 630 aa  218  4e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  27.88 
 
 		 775 aa  216  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  30.06 
 
 		 630 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  27.42 
 
 		 771 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  29.91 
 
 		 709 aa  216  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  29.46 
 
 		 629 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1370  peptidoglycan glycosyltransferase  29.36 
 
 		 808 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0776138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 		 691 aa  214  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00541  putative penicillin-binding protein  28.46 
 
 		 609 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  27.63 
 
 		 595 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1492  penicillin-binding protein 2  29.72 
 
 		 670 aa  214  3.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.149057 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  26.49 
 
 		 628 aa  214  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  26.78 
 
 		 801 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  27.54 
 
 		 766 aa  212  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  28.53 
 
 		 632 aa  212  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>