More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14210 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14210  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 709 aa  1454    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1260  penicillin-binding protein 2  50.69 
 
 		 724 aa  639    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.022216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06100  penicillin-binding protein 2  48.12 
 
 		 716 aa  616  1e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000017381 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0673  penicillin-binding protein 2  37.81 
 
 		 669 aa  427  1e-118  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.810569 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  32.32 
 
 		 645 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.11 
 
 		 647 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31.17 
 
 		 643 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  31.39 
 
 		 639 aa  295  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  32.21 
 
 		 636 aa  290  7e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1685  penicillin-binding protein 2  31.51 
 
 		 670 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361275  normal  0.0578136 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 		 642 aa  284  5.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  30.66 
 
 		 678 aa  277  4e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1542  penicillin-binding protein 2  30.9 
 
 		 697 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2661  penicillin-binding protein 2  32.04 
 
 		 667 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.148339 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  31.75 
 
 		 640 aa  273  7e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  30.56 
 
 		 716 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  30.13 
 
 		 574 aa  272  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  28.39 
 
 		 646 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  29.85 
 
 		 775 aa  262  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  28.98 
 
 		 645 aa  261  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1138  peptidoglycan glycosyltransferase  31.81 
 
 		 687 aa  261  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2465  penicillin-binding protein 2  30.12 
 
 		 686 aa  260  8e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  30.91 
 
 		 619 aa  256  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  28.62 
 
 		 664 aa  256  8e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  30.32 
 
 		 636 aa  256  9e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  29.21 
 
 		 681 aa  256  9e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 		 767 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  29.78 
 
 		 703 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1214  peptidoglycan glycosyltransferase  31.1 
 
 		 729 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  28.82 
 
 		 634 aa  253  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  29.06 
 
 		 771 aa  254  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 		 618 aa  253  7e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  31.49 
 
 		 586 aa  250  6e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  28.51 
 
 		 800 aa  250  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  30.71 
 
 		 630 aa  249  9e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  28.8 
 
 		 662 aa  248  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0769  penicillin-binding protein 2  29.55 
 
 		 644 aa  249  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.116672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  28.77 
 
 		 803 aa  248  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  28.77 
 
 		 809 aa  248  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  29.08 
 
 		 802 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  28.62 
 
 		 803 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  27.91 
 
 		 610 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  28.62 
 
 		 802 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  28.62 
 
 		 802 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  28.62 
 
 		 802 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  28.62 
 
 		 802 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  28.7 
 
 		 661 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  28.83 
 
 		 766 aa  243  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  29.85 
 
 		 609 aa  240  5e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  29.52 
 
 		 646 aa  240  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  31.22 
 
 		 611 aa  239  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  31.41 
 
 		 626 aa  239  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  28.84 
 
 		 679 aa  239  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  29.25 
 
 		 641 aa  238  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  29.69 
 
 		 602 aa  238  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  30.43 
 
 		 597 aa  238  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  29.69 
 
 		 602 aa  238  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  28.25 
 
 		 618 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  28.51 
 
 		 801 aa  237  6e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  29.55 
 
 		 617 aa  237  6e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  28.92 
 
 		 617 aa  236  8e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  28.75 
 
 		 618 aa  236  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  27.96 
 
 		 618 aa  236  8e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  28.25 
 
 		 618 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  29.06 
 
 		 631 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  27.78 
 
 		 626 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  28.91 
 
 		 631 aa  234  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  27.84 
 
 		 633 aa  234  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.65 
 
 		 618 aa  234  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  28.1 
 
 		 618 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  28.1 
 
 		 618 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  28.57 
 
 		 760 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 765 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 765 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  27.56 
 
 		 709 aa  233  9e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  27.73 
 
 		 610 aa  233  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1352  penicillin-binding protein  28.69 
 
 		 617 aa  233  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  28.59 
 
 		 618 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  28.57 
 
 		 647 aa  232  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  28.42 
 
 		 801 aa  232  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  28.31 
 
 		 761 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  28.75 
 
 		 631 aa  232  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  30.28 
 
 		 701 aa  232  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  29.04 
 
 		 619 aa  232  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  28.31 
 
 		 646 aa  232  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  27.91 
 
 		 640 aa  232  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  28.53 
 
 		 646 aa  232  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  27.93 
 
 		 632 aa  231  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5266  peptidoglycan glycosyltransferase  30.24 
 
 		 764 aa  231  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537977 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  28.71 
 
 		 627 aa  231  4e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  28.48 
 
 		 631 aa  231  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  28.42 
 
 		 801 aa  231  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  28.42 
 
 		 756 aa  231  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  27.87 
 
 		 793 aa  231  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  28.04 
 
 		 764 aa  230  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  27.07 
 
 		 588 aa  229  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0518  penicillin-binding protein 2  29.47 
 
 		 625 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002903 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  28.2 
 
 		 635 aa  228  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7279  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.48 
 
 		 692 aa  227  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.78 
 
 		 671 aa  227  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000118475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>