More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0531 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  64.12 
 
 		 634 aa  788    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  66.1 
 
 		 641 aa  869    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  67.24 
 
 		 647 aa  846    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  55.73 
 
 		 610 aa  738    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  57.83 
 
 		 640 aa  724    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  69.38 
 
 		 643 aa  902    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 646 aa  1326    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  39.42 
 
 		 615 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  35.43 
 
 		 645 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  36.11 
 
 		 636 aa  355  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  35.38 
 
 		 647 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.07 
 
 		 643 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  36.06 
 
 		 801 aa  350  6e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  33.11 
 
 		 646 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 		 634 aa  343  4e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  35.22 
 
 		 645 aa  344  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0805  penicillin-binding protein 2  34.63 
 
 		 648 aa  342  9e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0246  hypothetical protein  34.8 
 
 		 596 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  34.18 
 
 		 639 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  36.35 
 
 		 574 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 		 642 aa  334  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  35.46 
 
 		 801 aa  333  4e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  35.3 
 
 		 801 aa  333  6e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1607  peptidoglycan glycosyltransferase  34.67 
 
 		 650 aa  332  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.188503  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3305  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 600 aa  329  8e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.374594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  35.55 
 
 		 683 aa  329  8e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  34.51 
 
 		 803 aa  329  9e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  34.51 
 
 		 803 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  34.51 
 
 		 809 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  34.01 
 
 		 703 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  34.57 
 
 		 802 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  34.57 
 
 		 802 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  34.57 
 
 		 802 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  34.57 
 
 		 802 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0286  penicillin-binding protein 2  34.12 
 
 		 655 aa  328  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0501  penicillin-binding protein 2  35.03 
 
 		 679 aa  327  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0109803 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  34.52 
 
 		 802 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  35.43 
 
 		 681 aa  326  1e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  33.98 
 
 		 764 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  33.98 
 
 		 761 aa  324  3e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  33.71 
 
 		 756 aa  324  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  34.57 
 
 		 766 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  33.82 
 
 		 760 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1404  penicillin-binding protein 2  35.46 
 
 		 619 aa  323  6e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  34.31 
 
 		 775 aa  323  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  33.82 
 
 		 765 aa  323  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  33.82 
 
 		 765 aa  323  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0323  penicillin-binding protein 2  33.88 
 
 		 771 aa  323  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3202  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.23 
 
 		 654 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000159747  normal  0.0376991 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0049  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 		 800 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 		 767 aa  321  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0191  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.89 
 
 		 651 aa  321  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.100713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2024  peptidoglycan glycosyltransferase  34.61 
 
 		 635 aa  320  3.9999999999999996e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0252806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  34.39 
 
 		 636 aa  320  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0297  peptidoglycan glycosyltransferase  35.12 
 
 		 648 aa  320  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  34.8 
 
 		 673 aa  319  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  32.95 
 
 		 632 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1741  penicillin-binding protein 2  34.77 
 
 		 635 aa  317  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  33.76 
 
 		 793 aa  318  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2015  penicillin-binding protein 2  33.95 
 
 		 664 aa  317  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.350589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  34.54 
 
 		 609 aa  316  7e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3336  penicillin-binding protein 2  33.95 
 
 		 661 aa  316  9e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.101534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1463  peptidoglycan glycosyltransferase  33.13 
 
 		 655 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37559  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1393  penicillin-binding protein 2, putative  34.71 
 
 		 621 aa  314  2.9999999999999996e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0265808 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  32.08 
 
 		 678 aa  312  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0225  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 		 691 aa  312  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.466269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1455  peptidoglycan glycosyltransferase  32.72 
 
 		 657 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.991408  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00580  putative penicillin-binding protein 2  34.05 
 
 		 622 aa  311  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  33.39 
 
 		 618 aa  307  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1537  penicillin-binding protein 2  33.6 
 
 		 646 aa  308  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  32.73 
 
 		 618 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  31.38 
 
 		 755 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 		 610 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  31.88 
 
 		 627 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0178  penicillin-binding protein 2  33.22 
 
 		 588 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  32.41 
 
 		 618 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  32.41 
 
 		 618 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0357  penicillin-binding protein 2  34.72 
 
 		 681 aa  303  5.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  32.41 
 
 		 618 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  32.51 
 
 		 618 aa  302  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  33.86 
 
 		 586 aa  301  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  32.3 
 
 		 629 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  31.61 
 
 		 631 aa  299  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0236  penicillin-binding protein 2  34.1 
 
 		 646 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0864486  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0242  peptidoglycan glycosyltransferase  34.1 
 
 		 646 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  32.67 
 
 		 662 aa  298  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  32.5 
 
 		 629 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 		 618 aa  297  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2504  penicillin-binding protein 2  33.28 
 
 		 669 aa  297  4e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0162762  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  33.39 
 
 		 611 aa  297  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  32.5 
 
 		 629 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  34.84 
 
 		 619 aa  296  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  31.28 
 
 		 640 aa  296  7e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.22 
 
 		 618 aa  296  8e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  32.14 
 
 		 691 aa  295  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  32.5 
 
 		 629 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  30.87 
 
 		 646 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  30.81 
 
 		 602 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0104  penicillin-binding protein 2  32.83 
 
 		 599 aa  295  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.14442  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  31.25 
 
 		 630 aa  295  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>