More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0993 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2823  penicillin-binding protein 2  62.75 
 
 
755 aa  797    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.774814 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0993  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
602 aa  1230    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223837  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0161  penicillin-binding protein 2  56.3 
 
 
640 aa  708    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.806413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2219  penicillin-binding protein 2  53.83 
 
 
600 aa  651    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  54.4 
 
 
597 aa  643    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2187  peptidoglycan glycosyltransferase  62.33 
 
 
595 aa  759    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  39.86 
 
 
646 aa  420  1e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  37.33 
 
 
634 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1046  cell division protein FtsI  38.99 
 
 
619 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.276341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  35.2 
 
 
643 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  34.51 
 
 
639 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  37.46 
 
 
643 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  34.15 
 
 
647 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 
636 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  33.62 
 
 
645 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  36.81 
 
 
609 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  35.99 
 
 
642 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0473  peptidoglycan glycosyltransferase  38.14 
 
 
681 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 
637 aa  367  1e-100  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  37.63 
 
 
628 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  36.36 
 
 
640 aa  364  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  35.79 
 
 
633 aa  363  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 
610 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  34.94 
 
 
628 aa  360  4e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0592  division-specific transpeptidase  35.57 
 
 
647 aa  360  5e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  36.66 
 
 
627 aa  359  8e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  34.52 
 
 
618 aa  355  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  37.06 
 
 
586 aa  354  2e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  34.7 
 
 
574 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  36.54 
 
 
611 aa  353  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  35.05 
 
 
618 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  35.05 
 
 
618 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  35.23 
 
 
618 aa  352  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  34.49 
 
 
637 aa  352  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  34.79 
 
 
610 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  34.94 
 
 
618 aa  352  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0470  peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 
648 aa  351  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  34.62 
 
 
618 aa  350  6e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  36.19 
 
 
618 aa  349  7e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0495  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 
662 aa  349  9e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0682861  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  35.9 
 
 
629 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  34.45 
 
 
618 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  33.95 
 
 
641 aa  346  6e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  35.56 
 
 
629 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 
618 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 
618 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  34.18 
 
 
618 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  34.18 
 
 
618 aa  346  8e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  32.78 
 
 
638 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  34.6 
 
 
602 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  34.6 
 
 
602 aa  345  1e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 
629 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.13 
 
 
618 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  35.38 
 
 
629 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  35.94 
 
 
631 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2326  peptidoglycan glycosyltransferase  34.24 
 
 
648 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1000  peptidoglycan glycosyltransferase  34.24 
 
 
648 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  35.59 
 
 
631 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 
630 aa  343  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  35.56 
 
 
627 aa  339  8e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  34.15 
 
 
618 aa  339  9e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  35.33 
 
 
631 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1603  peptidoglycan glycosyltransferase  33.62 
 
 
648 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  35.16 
 
 
626 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  36.25 
 
 
630 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2014  peptidoglycan glycosyltransferase  33.68 
 
 
624 aa  337  2.9999999999999997e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.327783  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3648  peptidoglycan glycosyltransferase  36.88 
 
 
649 aa  337  3.9999999999999995e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0783266 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  35.57 
 
 
678 aa  337  5e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  32.61 
 
 
633 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  32.61 
 
 
633 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  32.61 
 
 
633 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  32.61 
 
 
633 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  33.62 
 
 
634 aa  334  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  32.61 
 
 
633 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  34.39 
 
 
646 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  34.65 
 
 
626 aa  335  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  34.38 
 
 
646 aa  334  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  33 
 
 
652 aa  332  2e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  35.42 
 
 
619 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 
633 aa  331  2e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 
633 aa  331  3e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  32.89 
 
 
633 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 
633 aa  330  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 
633 aa  330  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  32.89 
 
 
633 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 
633 aa  330  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 
633 aa  330  4e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  34.11 
 
 
673 aa  330  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  32.89 
 
 
633 aa  330  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  32.47 
 
 
633 aa  330  7e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  32.17 
 
 
638 aa  329  7e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  32.07 
 
 
632 aa  329  9e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1465  peptidoglycan glycosyltransferase  34.32 
 
 
691 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.714694  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  32.36 
 
 
631 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  33.06 
 
 
634 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0661  penicillin-binding protein 2  31.22 
 
 
608 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.5709  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  32.72 
 
 
631 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  32.72 
 
 
631 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  32.72 
 
 
631 aa  327  4.0000000000000003e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  33 
 
 
645 aa  325  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>