More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0103 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 611 aa  1241    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  52.38 
 
 		 618 aa  620  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  49.19 
 
 		 645 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  48.49 
 
 		 630 aa  601  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  48.91 
 
 		 629 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  48.75 
 
 		 629 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  48.68 
 
 		 631 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  48.75 
 
 		 629 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  48.33 
 
 		 629 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  49.67 
 
 		 646 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  49.83 
 
 		 646 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  48.75 
 
 		 631 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.43 
 
 		 640 aa  575  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  47.32 
 
 		 632 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  48.41 
 
 		 631 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0263  peptidoglycan glycosyltransferase  48.52 
 
 		 630 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  49.44 
 
 		 646 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  48.34 
 
 		 633 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  48.51 
 
 		 626 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  45.04 
 
 		 636 aa  557  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  46.89 
 
 		 678 aa  556  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  48.04 
 
 		 630 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  47.01 
 
 		 629 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  47.18 
 
 		 629 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1271  penicillin-binding protein 2  47.12 
 
 		 627 aa  548  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  45.65 
 
 		 637 aa  546  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  47.79 
 
 		 640 aa  548  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  46.53 
 
 		 619 aa  543  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  47.32 
 
 		 630 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  45.81 
 
 		 801 aa  537  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  47.91 
 
 		 630 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  42.58 
 
 		 638 aa  537  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  45.62 
 
 		 664 aa  533  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  45.55 
 
 		 662 aa  534  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  43.1 
 
 		 793 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  44.48 
 
 		 612 aa  532  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  47.5 
 
 		 631 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  44.48 
 
 		 615 aa  531  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  46.23 
 
 		 617 aa  529  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  46.58 
 
 		 617 aa  531  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  43.09 
 
 		 610 aa  529  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  43.83 
 
 		 610 aa  531  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  42.97 
 
 		 766 aa  528  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  47.33 
 
 		 667 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  47.33 
 
 		 655 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  43 
 
 		 638 aa  525  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  43.57 
 
 		 618 aa  526  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  43.43 
 
 		 618 aa  528  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.58 
 
 		 641 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  43.28 
 
 		 637 aa  524  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  43.51 
 
 		 673 aa  518  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  43.59 
 
 		 627 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3364  penicillin-binding protein 2  44.39 
 
 		 801 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  44.71 
 
 		 801 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  41.61 
 
 		 628 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  43.99 
 
 		 703 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  43.59 
 
 		 626 aa  512  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  43.26 
 
 		 618 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  43.19 
 
 		 618 aa  512  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  42.28 
 
 		 607 aa  514  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  42.52 
 
 		 643 aa  513  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  43.09 
 
 		 618 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  43.26 
 
 		 618 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  43.26 
 
 		 618 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  43.09 
 
 		 618 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  43.26 
 
 		 618 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  43.09 
 
 		 618 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  43.09 
 
 		 618 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0178  putative penicillin-binding protein  44.78 
 
 		 809 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  44.78 
 
 		 803 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  42.83 
 
 		 625 aa  508  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  44.69 
 
 		 802 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0167  putative penicillin-binding protein  44.62 
 
 		 803 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.900799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  44.69 
 
 		 802 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  43.88 
 
 		 618 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  44.69 
 
 		 802 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0239  penicillin-binding protein 2  46.06 
 
 		 681 aa  505  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.289832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  44.69 
 
 		 802 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  44.54 
 
 		 652 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  41.42 
 
 		 636 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  44.59 
 
 		 802 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  42.43 
 
 		 631 aa  502  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  41.65 
 
 		 634 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  42.11 
 
 		 631 aa  501  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  43.68 
 
 		 761 aa  498  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  43.68 
 
 		 760 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  42.27 
 
 		 631 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  42.11 
 
 		 631 aa  501  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  41.97 
 
 		 634 aa  501  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  42.6 
 
 		 618 aa  499  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  43.68 
 
 		 765 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  43.68 
 
 		 765 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0176  peptidoglycan glycosyltransferase  43.83 
 
 		 683 aa  499  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  41.78 
 
 		 633 aa  497  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  41.28 
 
 		 633 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3110  penicillin-binding protein 2  43.66 
 
 		 775 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  41.78 
 
 		 633 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  41.78 
 
 		 633 aa  497  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  43.66 
 
 		 756 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  41.28 
 
 		 633 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>