More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2413 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  53.06 
 
 
629 aa  692    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  52.23 
 
 
631 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  52.23 
 
 
631 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  51.28 
 
 
631 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  53.22 
 
 
629 aa  696    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  52.15 
 
 
630 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  51.07 
 
 
646 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  53.46 
 
 
633 aa  677    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  53.06 
 
 
629 aa  691    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  50.83 
 
 
646 aa  659    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  53.22 
 
 
629 aa  694    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
632 aa  1285    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.8 
 
 
640 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  49.43 
 
 
626 aa  618  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.48 
 
 
618 aa  611  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  48.26 
 
 
629 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  48.76 
 
 
630 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  48.1 
 
 
629 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  49.34 
 
 
619 aa  582  1.0000000000000001e-165  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  47.99 
 
 
611 aa  579  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  46.2 
 
 
630 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  48.89 
 
 
630 aa  571  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3741  penicillin-binding protein 2  45.8 
 
 
631 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  46.04 
 
 
655 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  45.8 
 
 
667 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  45.19 
 
 
638 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  45.77 
 
 
610 aa  561  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  45.44 
 
 
618 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  45.48 
 
 
610 aa  560  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  43.26 
 
 
637 aa  553  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  44.52 
 
 
641 aa  552  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  48.36 
 
 
626 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  44.39 
 
 
627 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  43.65 
 
 
618 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  43.49 
 
 
618 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1633  peptidoglycan glycosyltransferase  43 
 
 
607 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113287  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  43.65 
 
 
618 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  43.65 
 
 
618 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  43.81 
 
 
618 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1563  peptidoglycan glycosyltransferase  43.44 
 
 
664 aa  535  1e-151  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.167338  normal  0.439071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  43.67 
 
 
638 aa  535  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  44.41 
 
 
617 aa  529  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  43.12 
 
 
662 aa  530  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  41.69 
 
 
618 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  44.06 
 
 
617 aa  527  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  42.35 
 
 
618 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  42.35 
 
 
618 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  42.35 
 
 
618 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  42.35 
 
 
618 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  40.68 
 
 
628 aa  524  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  42.35 
 
 
618 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  43.21 
 
 
625 aa  519  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  41.27 
 
 
643 aa  519  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  44.95 
 
 
618 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  43 
 
 
678 aa  515  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  41.75 
 
 
645 aa  512  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  40.89 
 
 
637 aa  511  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  41.51 
 
 
631 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  42.08 
 
 
673 aa  500  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1008  peptidoglycan glycosyltransferase  45.06 
 
 
640 aa  501  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  40.92 
 
 
634 aa  495  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0664  penicillin-binding protein  40.73 
 
 
612 aa  498  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164685  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  40.89 
 
 
631 aa  497  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  40.4 
 
 
615 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  40.72 
 
 
631 aa  495  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  40.39 
 
 
631 aa  493  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  40.23 
 
 
633 aa  491  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  39.52 
 
 
652 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  40.59 
 
 
634 aa  491  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  40.29 
 
 
632 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  40.89 
 
 
634 aa  491  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  40.06 
 
 
633 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  40.06 
 
 
633 aa  488  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  40.06 
 
 
633 aa  488  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  40.06 
 
 
633 aa  488  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  40.06 
 
 
633 aa  488  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  41.17 
 
 
703 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  39.94 
 
 
633 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  40.06 
 
 
633 aa  488  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  39.94 
 
 
633 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  40.06 
 
 
633 aa  488  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  40.06 
 
 
633 aa  488  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  39.94 
 
 
633 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  39.94 
 
 
633 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  39.94 
 
 
633 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  40.06 
 
 
633 aa  488  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  42.9 
 
 
801 aa  484  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  41.22 
 
 
636 aa  484  1e-135  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  43.15 
 
 
646 aa  484  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  41.23 
 
 
761 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3129  penicillin-binding protein 2  41.26 
 
 
760 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2499  peptidoglycan glycosyltransferase  41.26 
 
 
765 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3168  peptidoglycan glycosyltransferase  41.26 
 
 
764 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00456215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3113  peptidoglycan glycosyltransferase  41.26 
 
 
765 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.527872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3051  penicillin-binding protein 2  41.26 
 
 
756 aa  482  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0136763  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0590  penicillin-binding protein 2  41.77 
 
 
687 aa  477  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253689  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  40.13 
 
 
636 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0671  peptidoglycan glycosyltransferase  41.77 
 
 
687 aa  478  1e-133  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.195303  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04259  penicillin-binding protein 2  43.89 
 
 
686 aa  478  1e-133  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.209813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  40.63 
 
 
803 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>