More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0473 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00604  transpeptidase involved in peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 2)  56.67 
 
 		 633 aa  759    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0219544  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2991  penicillin-binding protein 2  56.67 
 
 		 633 aa  759    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000298209  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3708  penicillin-binding protein 2  51.63 
 
 		 610 aa  663    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000241854  decreased coverage  0.000000426063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2869  peptidoglycan glycosyltransferase  50.89 
 
 		 618 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000124923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0616  penicillin-binding protein 2  56.67 
 
 		 633 aa  759    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000054384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1715  penicillin-binding protein  49.27 
 
 		 652 aa  654    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1201  penicillin-binding protein 2  56.33 
 
 		 631 aa  746    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.621118  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1168  penicillin-binding protein 2  51.37 
 
 		 618 aa  672    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0473  penicillin-binding protein 2  100 
 
 		 638 aa  1320    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0538731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03333  hypothetical protein  65.27 
 
 		 632 aa  879    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0756  penicillin-binding protein 2  56.67 
 
 		 633 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2949  penicillin-binding protein 2  56.71 
 
 		 631 aa  746    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.151032  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1181  penicillin-binding protein 2  58.2 
 
 		 634 aa  763    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.142913  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3010  penicillin-binding protein 2  56.67 
 
 		 633 aa  759    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1170  penicillin-binding protein 2  55.84 
 
 		 633 aa  751    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.117814  normal  0.171214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  51.86 
 
 		 618 aa  673    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000207443  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0985  penicillin-binding protein 2  70.23 
 
 		 625 aa  904    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0655  penicillin-binding protein 2  56.67 
 
 		 633 aa  759    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000471681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3021  penicillin-binding protein 2  56.87 
 
 		 631 aa  749    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00366199  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0742  penicillin-binding protein 2  56.67 
 
 		 633 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.302066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  51.86 
 
 		 618 aa  673    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2964  penicillin-binding protein 2  57.74 
 
 		 636 aa  736    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0687  penicillin-binding protein 2  56.67 
 
 		 633 aa  759    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000614363  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  51.86 
 
 		 618 aa  673    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2356  peptidoglycan glycosyltransferase  49.84 
 
 		 641 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1849  penicillin-binding protein 2  56.71 
 
 		 631 aa  747    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0724  penicillin-binding protein 2  56.67 
 
 		 633 aa  759    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000167121  normal  0.141878 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0855  peptidoglycan glycosyltransferase  51.37 
 
 		 618 aa  652    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000272636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3150  penicillin-binding protein 2  58.45 
 
 		 634 aa  762    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0887106  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00593  hypothetical protein  56.67 
 
 		 633 aa  759    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0186683  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01217  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  76.8 
 
 		 641 aa  1044    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  51.86 
 
 		 618 aa  673    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  0.000000109983 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2935  peptidoglycan glycosyltransferase  50.4 
 
 		 627 aa  658    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357968  normal  0.0108979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1560  peptidoglycan glycosyltransferase  54.3 
 
 		 643 aa  711    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0321  peptidoglycan glycosyltransferase  53.33 
 
 		 637 aa  674    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.277376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0661  penicillin-binding protein 2  56.67 
 
 		 633 aa  759    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000749016  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0991  peptidoglycan glycosyltransferase  51.53 
 
 		 618 aa  676    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000594498  normal  0.0491088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  51.53 
 
 		 618 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0906078  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0699  peptidoglycan glycosyltransferase  50.49 
 
 		 618 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00364586  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1092  penicillin-binding protein 2  58.25 
 
 		 634 aa  744    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004222  penicillin-binding protein 2 (PBP-2)  76.06 
 
 		 638 aa  1045    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000026113  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01657  cell elongation-specific transpeptidase of penicillin-binding protein 2 (peptidoglycan synthetase)  53.57 
 
 		 637 aa  698    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.530513  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0682  penicillin-binding protein 2  56.67 
 
 		 633 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000220235  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0995  peptidoglycan glycosyltransferase  51.7 
 
 		 618 aa  677    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000900115  normal  0.206093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2588  peptidoglycan glycosyltransferase  51.86 
 
 		 610 aa  675    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0301777  normal  0.34105 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1135  transcriptional regulator, Fis family protein  52.19 
 
 		 628 aa  686    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0373953  normal  0.889933 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3485  peptidoglycan glycosyltransferase  50.89 
 
 		 618 aa  658    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000075861  unclonable  0.000000000100578 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0696  penicillin-binding protein 2  56.67 
 
 		 633 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.982712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0800  penicillin-binding protein 2  56.67 
 
 		 633 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.590609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3149  peptidoglycan glycosyltransferase  49.76 
 
 		 618 aa  624  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000790878  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0235  penicillin-binding protein 2  48.8 
 
 		 621 aa  620  1e-176  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2125  penicillin-binding protein 2  48.64 
 
 		 623 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000381771 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1212  penicillin-binding protein 2  48.42 
 
 		 623 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2065  penicillin-binding protein 2  48.42 
 
 		 623 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180725  normal  0.157728 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2070  penicillin-binding protein 2  48.64 
 
 		 623 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000525085 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1336  penicillin-binding protein 2  48.41 
 
 		 623 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.692108  hitchhiker  0.0000020031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1545  peptidoglycan glycosyltransferase  44.67 
 
 		 633 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00213347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4682  peptidoglycan glycosyltransferase  46.5 
 
 		 629 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4807  penicillin-binding protein 2  46.18 
 
 		 629 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0974911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  46.61 
 
 		 629 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4860  penicillin-binding protein 2  46.94 
 
 		 629 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4970  peptidoglycan glycosyltransferase  45.97 
 
 		 631 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3798  peptidoglycan glycosyltransferase  44.39 
 
 		 630 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.624413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2711  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.58 
 
 		 618 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4365  peptidoglycan glycosyltransferase  45.16 
 
 		 631 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.710659  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4825  penicillin-binding protein  45.16 
 
 		 631 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.436079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1106  penicillin-binding protein 2  45.28 
 
 		 646 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.906879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12060  penicillin-binding protein 2  45.11 
 
 		 646 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  43.64 
 
 		 645 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08390  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.18 
 
 		 640 aa  532  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.630549  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2413  peptidoglycan glycosyltransferase  43.51 
 
 		 632 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0462384  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0113  peptidoglycan glycosyltransferase  42.49 
 
 		 636 aa  524  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  43.07 
 
 		 611 aa  521  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0317  peptidoglycan glycosyltransferase  43.5 
 
 		 646 aa  519  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2509  penicillin-binding protein  43.41 
 
 		 629 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2313  peptidoglycan glycosyltransferase  43.41 
 
 		 629 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.124317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  41.71 
 
 		 673 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2848  peptidoglycan glycosyltransferase  44.73 
 
 		 626 aa  515  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.000000241166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3903  peptidoglycan glycosyltransferase  43.11 
 
 		 630 aa  509  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0079  peptidoglycan glycosyltransferase  40.92 
 
 		 766 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.456531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0054  peptidoglycan glycosyltransferase  40.71 
 
 		 793 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171257  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0062  substrate-binding transmembrane protein  41.56 
 
 		 801 aa  500  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.559785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3060  penicillin-binding protein 2  41.83 
 
 		 630 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.569181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1974  penicillin-binding protein 2  43.63 
 
 		 626 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0159  penicillin-binding protein 2  41.47 
 
 		 802 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.799571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0363  penicillin-binding protein 2  41.41 
 
 		 803 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3687  penicillin-binding protein 2  41.1 
 
 		 801 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.955324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6464  peptidoglycan glycosyltransferase  40.47 
 
 		 761 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2291  penicillin-binding protein 2  41.47 
 
 		 802 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.396249  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4401  peptidoglycan glycosyltransferase  40.44 
 
 		 767 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2371  penicillin-binding protein 2  41.47 
 
 		 802 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.4187  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2788  penicillin-binding protein 2  41.47 
 
 		 802 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1329  penicillin-binding protein 2  42.61 
 
 		 617 aa  490  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1326  penicillin-binding protein 2  42.78 
 
 		 617 aa  492  1e-137  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0143  penicillin-binding protein 2  41.56 
 
 		 802 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0145949  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0172  peptidoglycan glycosyltransferase  41.48 
 
 		 630 aa  490  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.82525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1513  cell elongation specific D,D-transpeptidase  40.52 
 
 		 615 aa  489  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0564593  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2022  peptidoglycan glycosyltransferase  41.51 
 
 		 667 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.238074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2165  penicillin-binding protein 2  41.44 
 
 		 655 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0080  peptidoglycan glycosyltransferase  40.42 
 
 		 703 aa  490  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.313327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>